根腐病胁迫下设施韭菜根际土壤细菌群落多样性及结构演替

文献类型： 中文期刊

第一作者： 高晓梅

作者： 高晓梅;池景良;李杨;敖静;刘晓辉;孙玉禄

作者机构：

关键词： 根际土壤;细菌群落;根腐病;Illumina Miseq高通量测序

期刊名称： 干旱区资源与环境

ISSN： 1003-7578

年卷期： 2021 年 006 期

页码： 153-160

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为分析设施栽培多年生韭菜根际土壤微生物群落结构和多样性,探寻韭菜根腐病感病程度与根际土壤微生物群落之间的关系,以辽宁省设施连作韭菜根际土壤为研究对象,应用Illumina MiSeq高通量测序技术,对病情指数不同地块的土壤进行16S r RNA基因V3-V4变异区序列扩增子进行分析,研究多年生韭菜感染根腐病后根际土壤细菌群落组成、结构及多样性变化。结果发现:从3组病情指数不同（H组:健康;Rl组:DI≤20的轻度发病组;Rh组:DI>20重度发病组）的18个根际土壤共获得1029093条有效序列,6104个OTU,经分类注释为39门,134个纲,336个目,573个科,1119个属,2353个种。α多样性指数表明,随着病情的加重韭菜根际土壤细菌群落的Shannon、Chao1、ACE指数呈现先增加后稍减少的趋势,即HRh>Rl。β多样性分组差异分析表明,感病根际土壤（Rl&Rh）与健康根际土壤（H）细菌群落结构、丰度均存在一定差异,韭菜感染根腐病后,变形菌门、绿弯菌门、酸杆菌门、拟杆菌门相对丰度有所提高,而放线菌门和芽单孢菌门丰度减少。采用菌群差异LEfSe分析发现在属级以下水平Bacillus asahii和Bellilinea在感病韭菜根际中相对丰度显著降低（P<0.05,Wilcoxon秩和检验）,而Bryobacter则在重度发病组（Rh）明显富集。db-RDA相关性分析表明,韭菜根际土壤细菌群落与根腐病病情指数DI明显相关,即随着感病程度加重细菌群落结构和多样性逐渐演替。综上分析发现,韭菜多年生宿根感染根腐病后,根际土壤中富集部分微生物类群,根际土壤细菌群落多样性发生改变,打破原有的群落平衡,细菌核心微生物类群由健康向亚健康发生演替,且与病害发生程度密切相关。

分类号： S436.33

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