烟草SAUR基因家族鉴定及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 吴孟婷
作者: 吴孟婷;籍燕;周东新;刘国祥;燕思凡;李媛;宁扬;林天然;李洋洋;张兴伟;程崖芝
作者机构:
关键词: 烟草;SAUR;生物信息学;进化分析;表达分析
期刊名称: 中国烟草科学
ISSN: 1007-5119
年卷期: 2024 年 45 卷 006 期
页码: 17-26,38
收录情况: CSCD
摘要: 为明确SAUR基因家族在植物生长发育和胁迫响应中的分子生物学机制,利用生物信息学手段,鉴定了烟草SAUR家族基因,分析了其进化关系、理化性质、基因及蛋白结构、启动子元件、染色体分布和叶片表达模式等。结果表明,在烟草中共鉴定出137个NtSAUR基因,分布在23条染色体上,分为4个亚族;仅4个基因含内含子,同一分支成员蛋白序列高度保守;NtSAUR启动子存在植物生长发育、环境胁迫、激素及光响应4类顺式作用元件;烟草SAUR基因在进化过程中可能发生大量的串联复制和染色体片段性复制;基于叶片表达模式分析,筛选到2个可能参与烟草叶片形态建成的基因和6个可能调控叶片衰老的基因。以上研究结果将为下一步烟草SAUR基因功能验证提供理论依据。
分类号: S572
- 相关文献
[1]普通烟草HSP20基因家族成员鉴定及表达分析. 赵泽玉,杜甫,李子玮,王琰琰,王荣浩,施友志,孙晋浩,田震,赵清海,管恩森,孙刚,王大海,王朔,李志远. 2024
[2]烟草NtMYB44b转录因子基因克隆以及生物信息学和表达分析. 余婧,郭玉双,雷波,张孝廉,赵德刚. 2020
[3]芥菜SRO基因家族全基因组鉴定与表达分析. 杨巍,赵丽芬,唐兵,周麟笔,杨娟,莫传园,张宝会,李飞,阮松林,邓英. 2024
[4]白菜型油菜IGT基因家族的鉴定与表达分析. 裴大妹,王龙,马茜茹,李华欣,肖麓. 2024
[5]真菌类过氧化物酶体增殖因子PEX11基因家族生物信息学研究. 张昕,姜华,王艳丽,张震,毛雪琴,柴荣耀,邱海萍,杜新法,王教瑜,孙国昌. 2012
[6]白菜型油菜CCT基因的全基因组鉴定及表达模式分析. 李华欣,王龙,马茜茹,裴大妹,肖麓. 2024
[7]藜麦GRF转录因子家族的鉴定及表达分析. 时丕彪,何冰,费月跃,王军,王伟义,魏福友,吕远大,顾闽峰. 2019
[8]胡萝卜DcSE基因的克隆、进化及根发育过程表达分析. 王堃,谭国飞,孟平红,罗庆,钟秀来,王天文. 2021
[9]葡萄全基因组WRKY转录因子鉴定和分析. 苏玲,王鹏飞,杨阳,任凤山,王咏梅,陈万钧. 2019
[10]甜瓜syntaxin家族基因鉴定及其对白粉病菌响应分析. 董玉梅,孙建磊,王崇启,肖守华,高超,焦自高. 2019
[11]肺形则耳变温结实相关基因Ppcsl-1的克隆及功能预测. 周烁红,沈颖越,蔡为明,金群力,范丽军,宋婷婷,冯伟林,章宵华. 2016
[12]枸杞SWEET基因家族鉴定及其与可溶性糖含量关系. 尹跃,秦小雅,赵建华,杨萍,何军,安巍. 2024
[13]水稻YABBY家族的全基因组鉴定与表达分析. 董皓,李懿星,王天抗,宋书锋,邱牡丹,张志槊,张立成,傅岳峰,李莉. 2020
[14]肺形侧耳变温结实相关基因Ppcsl-1的克隆及功能预测. 周烁红,沈颖越,蔡为明,金群力,范丽军. 2016
[15]牵牛E3泛素连接酶PNRma1基因的克隆及抗旱相关性分析. 代锦绣,董轩名,倪欢欢,董延龙,金晓霞. 2017
[16]miR-18a-5p在鸡不同生长时期的表达及其生物信息学分析与靶基因预测. 黄正洋,黄华云,穆春宇,李春苗,王钱保,黎寿丰,赵振华. 2021
[17]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021
[18]大白菜TPS基因家族鉴定及其在高温胁迫下的表达分析. 庞强强,蔡兴来,孙晓东,张文,周曼. 2020
[19]大豆GmGLRs基因全基因组鉴定与表达分析. 崔晓霞,赵硕,郭书巧,束红梅,何晓兰,倪万潮,巩元勇,刘来华. 2019
[20]板栗PPO基因克隆及生物信息学分析. 程丽莉,程运河,兰彦平,曹庆昌,胡广隆,苏淑钗. 2020
作者其他论文 更多>>
-
雪茄烟新品种雪雅香1号的选育及特征特性
作者:刘国祥;李媛;戴培刚;王剑;霍光;刘好宝;籍燕;陈志强;潘勇;杨爱国;张兴伟
关键词:雪茄烟;品种;雪雅香1号;选育;特征特性
-
多腔室秸秆原位炭化还田设备设计
作者:姚宗路;张帅帅;贾吉秀;霍丽丽;李粤;朱本海;李媛;赵立欣
关键词:秸秆;热解原位炭化;生物炭还田;设备;能量分析
-
番茄潜叶蛾对不同类型杀虫剂的敏感性
作者:张治科;李媛;张宁
关键词:番茄潜叶蛾;杀虫剂;毒力测定;田间防效
-
硅在植物中抵御生物胁迫机制的研究进展
作者:王琰琰;王剑;潘勇;贾志忠;汪鹏;李子玮;杜甫;赵泽玉;谭再钰;吴英乔;方秀;张兴伟;施友志
关键词:硅;植物;生物胁迫;病虫害
-
微生物燃料电池处理畜禽养殖废水研究进展及展望
作者:刘壮壮;李同;刘崇涛;宋建超;李洋洋;陶秀萍;尚斌;张万通;蔡阳扬
关键词:微生物燃料电池;畜禽养殖;废水;污染物去除;产电性能;技术耦合
-
中国农业科学院烟草研究所在雪茄烟种质资源群体结构研究方面取得新进展
作者:张兴伟;刘国祥
关键词:
-
烟草基因组辅助育种研究进展
作者:蒋家乐;余文;程崖芝;巫升鑫;石好琪;李彩月;丁安明;王卫锋
关键词:烟草;基因组辅助育种;分子标记辅助选择;全基因组选择;基因编辑