烟草NtJAR1家族基因的鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 章照停

作者： 章照停;杨梦璇;徐方正;毛东平;李世金;王倩;徐刚;宁扬

作者机构：

关键词： JAR1基因;烟草;冷胁迫;生物信息学分析;表达模式

期刊名称： 湖南农业科学

ISSN： 1006-060X

年卷期： 2025 年 006 期

页码： 8-15

摘要： 为了研究烤烟激素代谢和逆境胁迫响应机制，基于烟草（Nicotiana tabacum L.）全基因组数据，利用生物信息学方法鉴定了烟草中茉莉酸-异亮氨酸合成酶基因（Jasmonoyl-isoleucine synthetase,JAR1）家族，并分析该家族的蛋白质理化性质、进化关系以及基因结构、保守结构域、启动子核心顺式作用元件以及转录模式。结果表明：烟草中共鉴定到12个NtJAR1基因，在系统发育上将其分为2个亚族（Ⅰ类和Ⅱ类），包含360～630个氨基酸，等电点为5.56～6.93，分子量为40.22～68.94 KDa，均为两性蛋白且热稳定性一致，除NtJAR1-3、NtJAR1-6、NtJAR1-9和NtJAR1-12位于细胞核中之外，剩余蛋白均定位在细胞质中；所有NtJAR1基因均具有GH3保守结构域，含有3～5个外显子，2～5个内含子；烟草NtJAR1基因家族的表达模式具有组织特异性，NtJAR1-5、NtJAR1-6、NtJAR1-8、NtJAR1-10、NtJAR1-7、NtJAR1-4在根中高度表达，NtJAR1-3、NtJAR1-12则在叶中高度表达；NtJAR1基因响应烟草冷胁迫，其中NtJAR1-7、NtJAR1-8、NtJAR1-10、NtJAR1-12基因在冷胁迫条件下表达上调。

分类号： S572

  • 相关文献

[1]冷胁迫下甘蓝型冬油菜表达蛋白及BnGSTs基因家族的鉴定与分析. 马骊,白静,赵玉红,孙柏林,侯献飞,方彦,王旺田,蒲媛媛,刘丽君,徐佳,陶肖蕾,孙万仓,武军艳. 2023

[2]稻曲病菌交配型基因MAT1-2-1和MAT1-2-8的特性分析. 雍明丽,于俊杰,曹慧娟,俞咪娜,潘夏艳,宋天巧,刘永锋. 2021

[3]橡胶树磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因HbPPC1的克隆和表达分析. 王岳坤,阳江华. 2015

[4]大豆醛酮还原酶超家族的鉴定及表达分析. 厉苏宁,赵现伟,孙丽萍,赵朝森,王瑞珍,郭兵福. 2022

[5]牦牛CAPN3基因的克隆及组织表达特异性. 王英杰,阎萍,潘和平,吴晓云,李明霞. 2016

[6]花生FAD基因家族的全基因组鉴定与表达模式分析. 阮建,单雷,李新国,郭峰,孟静静,万书波,彭振英. 2018

[7]荔枝蒂蛀虫海藻糖酶基因克隆及生物信息学分析. 姚琼,梁展图,段双刚,董易之,徐淑,李文景. 2024

[8]小麦VQ家族全基因组鉴定与表达分析. 李虎滢,魏春茹,孟钰玉,范润侨,于秀梅,刘大群. 2020

[9]紫花苜蓿耐盐性相关NAC转录因子的挖掘及表达分析. 荣梦茹,余如刚,韦英铭,王国良,杜雪玲,杨改梅,高佳佳. 2024

[10]玉米抗白斑病菌侵染的主要生理机制及其谷胱甘肽过氧化物酶相关基因响应模式分析. 夏茹,陈泽辉,祝云芳,李永鹏,谭洋,陈通通,赵玳琳,田山君. 2025

[11]菠萝蜜WRKY基因家族注释及在低温胁迫下的表达模式分析. 马湘玮,朱鹏锦,杜英俊,宋奇琦,叶维雁,唐秀观,何江,钟云婕,欧景莉,庞新华. 2025

[12]高粱GAox基因家族的鉴定及其在种子萌发中的表达分析. 姜昱雯,任艳,陈满静,赵强,张国兵,沈佳奇,高旭,邵明波. 2025

[13]牛SLC38A基因家族的生物信息学分析及其在前体脂肪细胞分化中表达模式分析. 焦若普,张久盘,宋雅萍,姜超,宋小雨,杨东梅,龚红芳,马艺伦,黄永震,房义,马云,魏大为. 2025

[14]大豆GmROP基因家族的鉴定及表达分析. 祝甜甜,何小琪,史靖慧,张威,陈华涛,宋丽. 2025

[15]南亚果实蝇谷胱甘肽S-转移酶基因的鉴定及组织表达. 田晓丽,许冬,刘毅,万鹏,明行,桂连友,张国辉. 2025

[16]烟草NtMLO家族全基因组序列鉴定及表达分析. 张孝廉,张吉顺,余世洲,余婧,赵德刚. 2019

[17]烟草TPP基因家族鉴定及表达模式分析. 刘涛,郭存,邹宗庆,金立权,吴健,文利超,邓智超,初雨蒙,王凌涛,李伟,郭永峰. 2022

[18]普通烟草KCS基因家族的鉴定及非生物胁迫表达模式分析. 郭存,刘晓姗,李志远,李浩昊,段柯帆,郑吉云,田华,王瑗申,商暾,叶柯妤,孙晋浩,李东徽,貊志杰,李尊强. 2024

[19]普通烟草GRAS基因家族鉴定及表达模式分析. 孙晋浩,吴昌健,管恩森,熊党安,周天宇,陈悦,刘晓姗,赵清海,王大海,李志远,马志远,田震. 2024

[20]烟草CYP71D亚家族的生物信息学分析. 王蕾,赵泽玉,陈明丽,龚达平. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序