流感病毒M2质子通道抑制机理的计算化学模拟和理论分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 秦艳
作者: 谢能中;杜奇石;黄日波
作者机构:
关键词: 流感病毒;金刚烷;M2质子通道;抑制机理
期刊名称: 广西科学院学报
ISSN: 1002-7378
年卷期: 2014 年 04 期
页码: 289-293
摘要: 【背景】A型流感病毒的M2质子通道蛋白的X-ray和NMR结构已于2008年测定,并成为发展抗流感的重要药物靶标,但学术界对于抑制剂的作用机理尚有争论。【方法】用SYBYL软件作M2通道蛋白与金刚烷胺抑制剂的对接计算,在可能的对接位点(Asp-44,Trp-41,His-37)上用精确的量子化学方法计算对接能,并根据结构化学和物理化学的原理分析抑制剂的作用机理。【结果】计算了金刚烷胺与M2质子通道的多个可能的结合位点的结合能,包括His-37,Trp-41和Asp-44。【结论】金刚烷胺对M2的抑制是一个动态过程,可能有多个位点结合。金刚烷胺穿透细胞膜后在通道出口与Asp-44形成盐桥,质子流使盐桥解离,金刚烷胺再进入通道与芳香氨基酸Trp-41(或His-37)形成阳离子-键。
分类号: O641.121`R373.13
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