基于SNP标记的穞稻与栽培稻的遗传多样性分析及萌发耐淹性评价

文献类型: 中文期刊

第一作者: 孙志广

作者: 孙志广;潘根;陈庭木;李景芳;赵利君;迟铭;徐波;邢运高;刘金波;刘晓敏;葛高宁;徐锦涛;王宝祥;徐大勇

作者机构:

关键词: 穞稻;栽培稻;SNP;遗传多样性;萌发耐淹性

期刊名称: 中国农学通报

ISSN:

年卷期: 2022 年 030 期

页码: 6-13

收录情况: CSCD

摘要: 旨在分析穞稻与栽培稻间的遗传多样性,为穞稻的保护和开发利用提供分子依据。以包括穞稻在内的48份水稻种质资源为试验材料,利用1K mGPS SNP芯片进行基因分型,使用PowerMaker 3.25软件进行UPGMA聚类分析。结果表明,4785对多态性SNP标记共检测出9570个等位基因,平均每对标记检测出2个等位变异;多态性信息含量(PIC)变化范围为0.0400~0.5957,平均值为0.3123,基因多样性指数(GD)变化范围为0.0408~0.6667,平均值为0.3839。UPGMA聚类分析将48份参试种质划分为2个亚群,即籼稻亚群和粳稻亚群,其中穞稻分属于粳稻亚群。厌氧萌发耐受性评价表明,穞稻具有很强的耐低氧萌发能力,可为适宜直播水稻的培育提供重要的种质基础,同时本研究为穞稻优异基因的挖掘和利用提供理论基础。

分类号: S511

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