百脉根WRKY基因家族生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 马培杰
作者: 马培杰;李亚娇;舒健虹;王小利
作者机构:
关键词: 百脉根;WRKY;基因家族
期刊名称: 分子植物育种
ISSN:
年卷期: 2023 年 014 期
页码: 4606-4617
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: WRKY转录因子是一个超家族的调节因子,参与植物的多种生物过程和逆境胁迫反应。然而,在百脉根中对WRKY家族还没有相关的研究。本研究共鉴定出79个LjWRKYs基因,它们不均匀分布在各染色体上的基因位点编码,与拟南芥At WRKYs进行系统发育分析,分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类。保守基序和外显子-内含子数目表明79个LjWRKYs在不同亚簇中均具有较大的差异,顺式作用元件结果显示在上游2 000 bp启动子区域包含多种逆境胁迫、激素和生长发育相关的元件。共线性结果有36对片段复制和1对串联重复复制共线性基因,且Ka/Ks均小于1。本研究通过分析百脉根WRKY基因家族的基本结构与性质,为深入研究百脉根WRKY基因家族提供了基础。
分类号: Q943.2
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