基于转录组的荔枝XTH家族基因的鉴定及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 董晨

作者： 董晨;魏永赞;王弋;郑雪文;李伟才

作者机构：

关键词： 荔枝(Litchi chinensis);木葡聚糖内切葡聚糖酶/水解酶;基因家族;生物信息分析;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2019 年 012 期

页码： 3865-3873

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究木葡聚糖内切葡聚糖酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase, XTH)基因家族在荔枝花穗发育过程中的分布及表达情况,本研究基于'妃子笑'荔枝花穗转录组数据,利用生物信息学研究方法,首次对'妃子笑'荔枝XTH基因家族进行鉴定,包括基因的基本物理和化学特征,亚细胞定位,蛋白质保守结构域,进化关系和表达模式.结果表明:Lc XTH基因家族成员有29个,其蛋白长度范围在37~311 AA之间,对应的相对分子量范围在4.398~35.711 k D之间,等电点(pI)范围为4.39~9.46.此外,亚细胞定位分析显示所有LcXTH蛋白均位于细胞壁;Lc XTH含有2个相对保守的结构域(Glycohydro16结构域和XETC结构域);系统发育树分析表明LcXTH基因家族分为四组(Ⅰ~Ⅳ组),不同发育阶段LcXTHF基因的表达模式不同.本研究为进一步对XTH基因的功能研究提供理论依据.

分类号： S667.1

  • 相关文献

[1]转录组荔枝Dof基因家族的鉴定及其表达. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2021

[2]基于转录组的荔枝ARF基因家族的鉴定及表达分析. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2017

[3]椰子GPAT基因家族的鉴定及生物信息学分析. 周倩倩,张照华,弓淑芳,夏志辉. 2024

[4]芥菜Trihelix转录因子家族全基因组鉴定分析. 李魁印,段丽丽,胡云,李伟,付文苑,杨巍,唐兵,常向彩. 2025

[5]高粱糖转运蛋白基因家族全基因组鉴定、分类及表达分析. 徐志军,刘洋,徐磊,安东升. 2019

[6]基于转录组的百香果ARF基因家族的鉴定及表达分析. 张小雪,韦晓霞,陈发兴. 2021

[7]甜樱桃GH3基因家族全基因组鉴定与表达分析. 侯黔东,沈天娇,余欢欢,仇志浪,文壮,张惠敏,吴亚维,文晓鹏. 2021

[8]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021

[9]菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析. 阮城城,胡福初,罗志文,王祥和,郭利军,李玉静,范鸿雁,韩冰,陈哲,张治礼. 2020

[10]桃WRKY基因家族全基因组鉴定和表达分析. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,周宗山,董庆龙. 2016

[11]辣椒紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定与表达特征. 程远,郭勤卫,郑佳秋,万红建. 2017

[12]大蒜WRKY基因家族的鉴定与生物信息学分析. 隋淑梅,黄思杰,田洁. 2023

[13]基于转录组的荔枝泛素结合酶基因家族的鉴定及表达分析. 董晨,李金枝,郑雪文,王弋,李伟才. 2022

[14]巴西橡胶树FKBP基因家族成员的鉴定及表达分析. 晁金泉,杨署光,陈月异,田维敏. 2018

[15]香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 杨会晓,孙媛媛,贾彩红,金志强,徐碧玉,王卓. 2019

[16]石榴SUT基因家族鉴定及其在籽粒发育过程中的表达分析. 骆翔,曹尚银,李好先,赵弟广,张富红,陈丽娜,Krishna Poudel,敬丹,唐丽颖. 2020

[17]荔枝GA2ox基因家族的鉴定及表达分析. 陈哲,王祥和,周文静,周瑞云,吴文碟,吴凤芝,范鸿雁,胡福初. 2021

[18]苹果TIFY家族基因鉴定及其在虫害胁迫下的表达分析. 梅闯,张小燕,闫鹏,艾沙江·买买提,冯贝贝,马凯,韩立群,董连新,王继勋. 2021

[19]菠萝酸性转化酶基因家族初步生物信息学及表达分析. 宋康华,侯晓婉,贾志伟,洪克前,谷会,张鲁斌. 2020

[20]巴西橡胶树膜联蛋白基因家族成员的鉴定和表达分析. 肖小虎,隋金蕾,戚继艳,方永军,王闯,唐朝荣. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序