口蹄疫病毒China/99基因组RNA序列测定及比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张显升

作者： 张显升;刘在新;赵启组;常惠芸;谢庆阁

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;China/99;参考毒株;基因组;序列分析

期刊名称： 中国科学. C辑, 生命科学

ISSN： 1006-9259

年卷期： 2003 年 生命科学33 卷 5 期

页码： 461-467

收录情况： CSCD

摘要： 测定了1999年我国口蹄疫流行毒株(china／99，Tibet)基因组全序列，China／99基因组RNA全长8173个核苷酸(nt)，开放阅读框含盖6999 nt，编码2332个氨基酸的聚合蛋白．5'和3'非翻译区(UTR)分别长108l和93 nt．China／99与12株参考株基因组序列比较发现：China／99与英国2001年流行毒、海南和西藏1999年流行毒ld基因的序列同源性高达97％以上，均属泛亚毒株；在牛和猪FMDV的功能未知区、p2和p3区存在较为显著的核苷酸序列差异，3a基因最为显著；l,la,lb,2a,2c,3b和3d基因没有核苷酸缺失或插入现象，属于病毒必需基因；口蹄疫病毒S片段、功能未知区和内部核糖体进入位点(IRES)二级结构均可分为3种类型．S片段和3'UTR折叠成一个三叶草类似结构．

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