基于高通量测序的肉牛垫料养殖床中细菌群落分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周德平

作者： 周德平;褚长彬;赵峥;姜震方;吴淑杭

作者机构：

关键词： 垫料养殖;肉牛;细菌种群结构;高通量测序

期刊名称： 上海农业科技

ISSN： 1001-0106

年卷期： 2016 年 06 期

页码： 26-27+41

摘要： 利用Roche 454GSFLX+高通量测序平台分析了肉牛垫料养殖床中的细菌群落结构,结果显示,从发酵床样品中共获得17 772条有效序列,其中优质序列有13 301条,在97%相似水平上聚为1 603个OTU分类单元;目水平上,细菌优势种群集中在芽孢杆菌目(21.70%)、红螺菌目(18.20%)、乳杆菌目(14.90%)、梭菌目(14.10%)、黄杆菌目(10.50%)、伯克氏菌目(5.50%)、黄单胞菌目(3.00%)、放线菌目(2.10%)和根瘤菌目(1.80%);属水平上,细菌的优势种群主要集中于醋酸杆菌属(15.17%)、金黄杆菌属(9.50%)、乳杆菌属(6.90%)、芽孢杆菌属(6.30%)、乳球菌属(6.0%)、高温放线菌属(3.50%)、类芽孢杆菌属(2.40%)、梭菌目(2.10%)、伯克氏菌属(2.10%)和葡萄糖醋杆菌属(1.80%)。

分类号： S823

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