香蕉抗病种质RLK-RGAs的克隆与序列差异分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐金刚

作者： 徐金刚;向旭;蔡礼鸿;黄秉智;孟祥春

作者机构：

关键词： 香蕉;抗病种质;类受体蛋白激酶;抗病基因同源序列

期刊名称： 农业科技通讯

ISSN： 1000-6400

年卷期： 2008 年 08 期

页码： 81-85

摘要： 利用其他植物抗病基因PK类保守域的9个结构域所设计简并引物,从抗镰刀菌枯萎病香蕉种质ROSE和GCTCV-119中分离了20个香蕉RGA片段,大小为530bp左右,其中14条DNA片段和6条cDNA片段。根据其推断的氨基酸序列,经过保守结构域分析,其结构域为S_TKc,为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族成员,包含4功能域,分别为ATP binding pocket,substrate binding pocket,catalytic loop和activation loop。具有9个高度保守的氨基酸区域:Ⅰ.FG(K/V/L/S)VY(K/R)G;Ⅱ.VAVK;Ⅲ.FxxE;Ⅳ.(L/V/I)Vx(I/V/L);Ⅴ.ALV;Ⅵ.D(L/I/V)K;Ⅶ.DFG;Ⅷ.G(T/S)xGY(L/I/A)PE;Ⅸ.D(Y/I)YS-(F/Y)G(V/I/M)。将这20条RGAs序列分别命名为Mu-PK1,Mu-PK2,……,Mu-PK20,并提交GenBank,获得登录号分别为EU293391-EU293404(DNA片段),EU338457-EU338462(cDNA片段)。

分类号： S668.1

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