内转录间隔区1(ITS-1);用于伊氏锥虫遗传多样性分析的一个争议性标记基因
文献类型: 中文期刊
第一作者: 田占成
作者: 田占成;刘光远;谢俊仁;沈辉;张丽艳;张萍;罗金
作者机构:
关键词: ITS-1;伊氏锥虫;刚果锥虫;遗传多样性;内转录间隔区;遗传距离;未定种;标记基因;最大似然法;流行病学研究
期刊名称: 中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第六次代表大会暨第十一次学术研讨会论文集
ISSN:
年卷期: 2011 年
页码: 1
收录情况: CSCD
摘要: 通过对长度为338-342bp的转录间隔区1(ITS-1)进行测序,对7个中国的伊氏锥虫分离株和一株刚果锥虫未定种进行了遗传定性。尽管中国的伊氏锥虫分离株间的转录间隔区1序列差异范围在0.3-3.8%之间,但以邻接法(NJ)和最大似然法(MP)构建的伊氏锥虫转录间隔区1序列发育树表明:中国的伊氏锥虫分离株具有遗传多样性的特点。对于刚果锥虫未定种而言,遗传距离上最为相关的是IL1180刚果锥虫。尽管刚果锥虫分离株转录间隔区1序列差异性为0.8-14.5%,但构建的发育遗传树并不能表明刚果锥虫分离株间的遗传多样性,可能是由于较少的分离株和序列参与了比较分析的原因。总之,这些数据可用于寄生虫动态监测...
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