Asia1型口蹄疫病毒第V群猪源和牛源毒株全基因组比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郑海学

作者： 郑海学;靳野;尚佑军;郭建宏;田宏;杨亚民;刘湘涛;才学鹏

作者机构：

关键词： FMDV;全基因组;受体结合位点;3A基因

期刊名称： 微生物学通报

ISSN： 0253-2654

年卷期： 2010 年 09 期

页码： 1312-1319

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了查明Asia1型FMDV第Ⅴ群猪源和牛源毒株的序列差异,采用RT-PCR方法,对Asia1型FMDV第Ⅴ群猪源分离毒株Asia1/HN/06的基因组全序列进行了扩增和测序,并与第Ⅴ群牛源和猪源参考毒株基因组进行比较分析。结果表明,Asia1/HN/06毒株全基因组序列长约8236nt[含38个A的poly(A)尾],其中5'NCR长1116nt,前导蛋白(L)编码区长603nt,结构蛋白与非结构蛋白编码区的核苷酸序列为6990nt,3′NCR长93nt,3′端是至少含有38个A的poly(A)尾巴。猪源毒株和牛源毒株的全基因比较分析表明,属于第Ⅴ群,全基因编码区核苷酸和氨基酸的同源性均为98.0%,主要差别是猪源毒株Asia1/HN/06在细胞受体结合位点变为RDD和155位置的N变为S或D,该群毒株3A更具有猪源毒株特征,有4个特异性氨基酸变异。明确了Asia1型FMDV第Ⅴ群猪源和牛源毒株的序列差异,为进一步利用反向遗传技术研究猪源和牛源毒株差异位点或基因在病毒表型变异中的作用奠定基础。

分类号： S852.65

  • 相关文献

[1]Asial型口蹄疫病毒第V群猪源和牛源毒株全基因组比较分析. 郑海学,靳野,尚佑军,郭建宏,田宏,杨亚民,刘湘涛,才学鹏. 2010

[2]鸭源H9N2 AIV血凝素基因序列比较. 万春和,傅光华,程龙飞,施少华,陈红梅,彭春香,林芳,林建生,黄瑜. 2012

[3]Asia1型口蹄疫病毒受体结合位点多样性. 李平花,白兴文,孙普,卢曾军,曹伟军,吴润,殷宏,刘在新. 2011

[4]C型口蹄疫病毒鼠源毒株3A基因的克隆及序列分析. 冯金瑞,常惠芸,丛国正,独军政,陈前锋,薛慧文. 2008

[5]口蹄疫病素3A基因在大肠杆菌中的高效表达. 薛青红,刘湘涛,张彦明,韩雪清,谢庆阁. 2002

[6]O型口蹄疫病毒不同宿主适应毒3A基因序列分析. 姚怀兵,赵毅,朱妍,张毅,刘宏,任方,黄炯. 2017

[7]口蹄疫病毒3A基因在大肠杆菌中的高效表达. 薛青红,刘湘涛,张彦明,韩雪清,谢庆阁. 2002

[8]稳定表达鼠源整联蛋白αvβ6的CHO-677细胞系的构建. 朱志坚,连凯琪,杨帆,张伟,郑海学,杨孝朴. 2015

[9]利用核糖体展示技术筛选口蹄疫病毒单链抗体基因. 代鹏. 2013

[10]Asia Ⅰ型FMDV全衣壳蛋白基因在昆虫细胞中的表达与免疫活性分析. 曹轶梅,孙甲川,卢曾军,孙普,郭建宏,刘在新. 2009

[11]FMDV细胞表面受体研究概述. 王燕琴,朱建勇,智宇. 2017

[12]基于表面等离子体共振(SPR)技术实时分析RGD基序与整联蛋白的相互作用. 李鹏飞,龚真莉,杜晓华,蒋韬. 2021

[13]利用蚀斑技术纯化猪水泡病病毒和人柯塞奇B_5型病毒. 薛景山,何建新,赵其祖,李德珍,李树春,潘其林. 1993

[14]猪O型FMDV抗体检测试纸条与ELISA对比试验. 杨继飞,杨苏珍,焦海燕,邓瑞广,杨艳艳,赵东,邢广旭,柴书军,李学伍,张改平. 2010

[15]过表达TPL2蛋白PK-15细胞系的建立及其功能验证. 郝军红,闫鸣昊,张大俊,张学刚,申超超,徐国伟,李国丽,张克山,郑海学,刘湘涛. 2020

[16]一种猪疱疹病毒的分离与鉴定. 田志军,仇华吉,童光志. 2007

[17]用原位杂交技术对牛组织中FMDV RNA检测和定位. 邵军军,常惠芸,林彤,丛国正,独军政,谢庆阁. 2007

[18]程序性细胞死亡因子10抑制Ⅰ型干扰素表达并促进FMDV复制. 曾宗波,马旭升,罗志宽,齐亚银,郑海学. 2021

[19]牦牛FMDV持续感染分离株非结构蛋白P2的克隆及基因特征分析. 魏小娟,常惠芸,张继瑜,丛国政,唐江山. 2007

[20]用原位杂交对BHK-21细胞中的FMDV定位和检测. 邵军军,常惠芸,林彤,丛国正,独军政,谢庆阁. 2005

作者其他论文 更多>>

微信小程序