普通烟草Dof转录因子家族的全基因组鉴定及分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 赵振祥
作者: 赵振祥;崔露莹;周东波;赵泽玉;张银霞;盖梦琦;解敏敏;蒲文宣;彭宇;李志远
作者机构:
关键词: 普通烟草;Dof转录因子;鉴定;比较基因组学;表达模式
期刊名称: 中国烟草科学
ISSN: 1007-5119
年卷期: 2022 年 43 卷 004 期
页码: 70-78
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: Dof(DNA binding with one finger)蛋白是植物特有的一类转录因子,在植物的多种生命进程中发挥着重要作用.为解析烟草中Dof家族成员在生长发育过程中的潜在作用,本研究利用比较基因组学、进化分析、共线性分析等方法解析烟草中的Dof家族成员的潜在生物学功能.结果表明,在烟草基因组中共鉴定到69个Dof转录因子,其Dof功能域在进化上十分保守,根据系统进化分析结果将其划分为9个亚家族.共线性分析表明,烟草中的16个Dof基因与拟南芥17个Dof基因有27个共线性基因对,同时,25个NtDof基因被检测到存在17个全基因组复制对,表明复制事件在烟草Dof基因家族的扩张中起关键作用.此外,表达模式分析表明NtDof基因的表达存在明显的组织特异性,其中NtDof05和NtDof28基因可能与根系生长发育有关.本研究对烟草基因组中的Dof转录因子进行了系统的鉴定和分析,为烟草Dof转录因子家族成员的功能研究奠定了基础.
分类号: S572.01
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