普通烟草WOX转录因子家族的全基因组鉴定及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李晓旭

作者： 李晓旭;郭存;蒲文宣;刘万峰;张银霞;孙楠;何鑫玺;刘成;许良涛;高军平

作者机构：

关键词： 普通烟草;WOX转录因子家族;茎顶端分生组织;根顶端分生组织;WUS

期刊名称： 中国烟草学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 001 期

页码： 90-100

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【背景】WOX（WUSCHEL-related homeobox）转录因子家族是植物特有的一类转录因子家族,被报道参与生长发育、细胞间通讯、干细胞分裂分化稳态调控和器官发育等过程。【方法】利用比较基因组学和生物信息学的方法,在烟草基因组中对WOX转录因子成员进行鉴定,并进行进化分析、共线性分析、保守基序分析以及表达模式等分析。【结果】（1）从烟草基因组中鉴定出23个WOX转录因子家族成员编码基因,其中15个NtWOX基因定位到染色体上;（2）系统发育分析表明,普通烟草和拟南芥的WOX转录因子被分成了3个亚支和9个亚家族;（3）共线性分析发现若干普通烟草NtWOX基因存在于普通烟草与拟南芥基因组的共线性区段中;（4）复制事件分析表明串联重复或者全基因组重复事件在普通烟草WOX家族扩张中起重要作用;（5）保守基序分析表明同一亚家族内NtWOX成员的保守基序的组织形式高度相似;（6）表达分析表明普通烟草NtWOX基因表达具有组织特异性;（7）GO注释分析发现普通烟草NtWOX转录因子参与组织器官发育、细胞间通讯过程和胁迫响应等生物学过程。【结论】本研究在普通烟草中鉴定并系统分析了WOX转录因子家族成员,为其功能研究奠定基础。

分类号： S572

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