类重金属ATP酶基因序列遗传变异分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李程鹏
作者: 李程鹏;孙一丁;刘辉;曾千春;王炎炎;马继琼;杨奕;许明辉
作者机构:
关键词: 亚洲栽培稻;野生稻;OsHMA2-like基因;进化
期刊名称: 西南农业学报
ISSN: 1001-4829
年卷期: 2016 年 29 卷 09 期
页码: 2009-2015
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: OsHMA2是水稻根和地上部一个主要的Zn和Cd的转运蛋白,在水稻基因组OsHMA2位点存在OsHMA2类似基因OsHMA2-like,编码蛋白包含水稻P1B型ATP酶重金属转运蛋白的功能域。对来自世界不同稻区的27份亚洲栽培稻和8份野生稻基因OsHMA2-like编码区序列进行了测序分析,以了解水稻OsHMA2-like序列的多样性,为发掘基因资源提供信息。OsHMA2-like核苷酸序列和氨基酸序列分析表明,在471bp的编码序列内发现了6个变异位点;Tajima'sD检验表明均不显著,说明这些位点属中性进化状态;6个变异位点中,第15、78、132、214、417位点碱基不引起氨基酸的变异,而第457位的变异使得5个供试材料(1个O.nivara,4个ARO品种和1个粳稻品种)由于提前形成终止子在C末端少3个氨基酸,ARO类品种在此位点上与TRJ、IND、TEJ存在显著差异,这暗示ARO类品种可能由O.nivara演化而来。
分类号: S511
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