谷子SiPRR73基因在不同光温组合条件下的可变剪切分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王晓蒙
作者: 王晓蒙;李剑峰;刘辉;王永芳;张小梅;王振山;桑璐曼;闫留延;龚珂珂;李兴杰;董志平;贾小平
作者机构:
关键词: 谷子;PRR73;光温互作;可变剪切
期刊名称: 江西农业大学学报
ISSN: 1000-2286
年卷期: 2023 年 45 卷 006 期
页码: 1324-1330
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: [目的]通过系统的可变剪切分析揭示SiPRR73参与谷子光温互作调控的可能机制.[方法]利用RT-PCR技术从"延谷11号"克隆生物钟基因SiPRR73,克隆低温(15℃)条件、自然条件、4个光温组合条件下的SiPRR73基因序列进行可变剪切分析.[结果]扩增片段经克隆、测序以及序列拼接后得到2928 bp的cDNA序列,包含2283 bp的CDS区域,编码760个氨基酸.可变剪切分析表明只有低温(15℃)和低温长日照(22℃、15 h光/9 h暗)条件下检测到的SiPRR73-1和SiPRR73-3剪切体具有完整的编码区,因而具有完整的REC和CCT结构域;自然条件和低温短日照(22℃、9 h光/15 h暗)条件检测到的SiPRR73-2、SiPRR73-4剪切体均缺失CCT结构域;高温(27℃)条件无论长日照还是短日照SiPRR73均形成缺失REC和CCT结构域的SiPRR73-5、SiPRR73-6两种剪切体.[结论]SiPRR73基因通过可变剪接的方式参与谷子的光温互作调节.
分类号: S515
- 相关文献
[1]谷子SiPRR73基因的光温调控模式及非生物胁迫响应特性. 闫留延,李剑峰,张世文,张博,王永芳,张小梅,祖超凡,王振山,桑璐曼,何占祥,贾小平,董志平. 2022
[2]谷子B3转录因子可变剪切体分析. 刘辉,王晓蒙,闫留延,王永芳,杨朋娟,龚珂珂,李兴杰,董志平,贾小平. 2024
[3]以光周期处理与分期播种试验综合鉴定大豆品种的光温反应. 费志宏,吴存祥,孙洪波,侯文胜,张宝石,韩天富. 2009
[4]光周期条件下对水稻光敏不育温度效应值的影响. 薛光行,申岳正. 1997
[5]光周期条件对水稻光敏不育温度效应值的影响. 薛光行,申岳正. 1997
[6]绵羊VEGF-B基因可变剪切体克隆与鉴定. 张立春,李梦姝,张珈溯,云巾宴,柳俭强,曹阳,金海国,夏广军. 2020
[7]绵羊胎盘生长因子基因可变剪切异构体克隆与表达分析. 张立春,李梦姝,柳俭强,云巾宴,曹阳,朴庆林,金海国. 2019
[8]三疣梭子蟹IAG基因结构及不同剪切体时空表达. 兰伟康,李光,高保全,刘萍,吕建建. 2023
[9]昆虫性别决定机制研究进展. 刘雅婷,谢文,张友军. 2015
[10]一个水稻早衰突变体基因的精细定位. 赵春德,张迎信,刘群恩,余宁,程式华,曹立勇. 2014
[11]北京鸭腹部脂肪组织的转录组特征分析. 陈黎,李国勤,田勇,沈军达,陶争荣,徐坚,曾涛,卢立志. 2016
[12]黑龙江省4个主栽水稻品种GS3基因克隆及表达模式分析. 张擘,杨学文,赵北平,郑福余,孙中义,孟庆英,吴立成,肖明纲. 2023
[13]绵羊VEGF-C基因可变剪切体克隆与序列分析. 张立春,李梦姝,曹阳,孙福亮,朴庆林,金海国,张明新. 2018
[14]药食兼用植物黄蜀葵全长转录组测序及特性分析. 叶广英,王再花,刘海林,李杰. 2023
[15]UV-C处理穿心莲转录组分析及穿心莲内酯合成相关基因挖掘. 孙铭阳,徐世强,李静宇,顾艳,梅瑜,张闻婷,周芳,王继华. 2022
[16]环状RNA的研究进展. 张潆月,马月辉,赵倩君. 2017
[17]绵羊皮肤组织VEGF-A基因可变剪切体存在的证实与鉴定. 张立春,李梦姝,柳俭强,曹阳,孙福亮,朴庆林,金海国,张明新. 2019
[18]穿心莲全长转录组测序及特性分析. 孙铭阳,徐世强,顾艳,梅瑜,周芳,李静宇,王继华. 2021
[19]水稻基因OsAFC2参与mRNA可变剪切调控. 梁蒙,张艳,徐妙云,张兰,王磊. 2016
[20]2个杏栽培品种需冷量差异的分子机制探索. 刘佳,黄大荣,尧美英,刘硕,张玉萍,张国薇. 2025
作者其他论文 更多>>
-
海南万宁大洲岛国家级海洋生态自然保护区鸟类调查
作者:徐泽君;文卓玉;刘辉;刘国琪;蔡挺;任荣霞;王合升
关键词:鸟类调查;大洲岛;野生动物保护
-
基于Illumina Miseq高通量测序分析贵州韭菜红酸汤微生物菌群多样性
作者:周罗娜;刘辉;王梅;陆邦富;李俊;刘军林;陈中爱
关键词:高通量测序;红酸汤;韭菜红酸汤;微生物多样性
-
谷瘟病、谷锈病混合发生区的药剂防控与产量损失
作者:马继芳;王永芳;白辉;张梦雅;刘佳;李志勇;董志平
关键词:谷瘟病;谷锈病;混合发生;防控;产量损失
-
1株猪源动物联合乳杆菌S7全基因组测序及生物信息学分析
作者:刘辉;季海峰;王四新;陈美霞;张董燕
关键词:猪;动物联合乳杆菌;全基因组测序;基因注释
-
光质对蓝莓果实品质的影响
作者:裴嘉博;刘辉;钟林炳;骆慧枫;刘禹姗;阮若昕;张琛;陈丽;郗笃隽
关键词:蓝莓;红光;蓝光;果实品质
-
不同基质配方处理对蓝莓果实产量及品质的影响
作者:裴嘉博;刘辉;马振华;钟林炳;骆慧枫;刘禹姗;邓宇;黄康康;张琛;陈丽;高国忠;郗笃隽
关键词:蓝莓;基质;果实品质
-
植物致病真菌乙二醛氧化酶基因功能研究
作者:冼雪梅;张宇;刘辉;王真辉;何其光
关键词:乙二醛氧化酶;功能结构域;胞外蛋白;植物-病原菌互作