番鸭细小病毒安徽分离株结构蛋白基因的克隆及序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 戴银
作者: 戴银;张丹俊;赵瑞宏;沈学怀;胡晓苗;侯宏艳;潘孝成;周学利
作者机构:
关键词: 番鸭细小病毒;结构蛋白基因;克隆;序列分析
期刊名称: 动物医学进展
ISSN: 1007-5038
年卷期: 2017 年 38 卷 04 期
页码: 24-27
收录情况: 北大核心
摘要: 为研究番鸭细小病毒(MDPV)安徽分离株的遗传变异特征,通过PCR扩增获得了MDPV结构蛋白(VP)基因全长序列AH-MDPV-VP,并将该序列与GenBank中登录的12条MDPV和鹅细小病毒(GPV)VP基因序列进行比对。结果显示,AH-MDPV-VP基因全长2 199bp,包括完整的VP1、VP2和VP3蛋白编码区。MDPV与GPV的VP基因部分序列一致,但具有明显的差异。进化分析显示,MDPV安徽分离株与基因重组型MDPV上海分离株SAAS-SHNH为同一分支,亲缘关系较近。同源性分析显示二者核苷酸序列同源性最高,为99.9%,且AH-MDPV-VP与GPV毒株SHFX1201的序列同源性也有89.5%。此外安徽分离株与其他MDPV的VP1、VP2和VP3基因同源性有逐步下降的趋势,而与GPV则相反呈上升趋势。进一步显示MDPV安徽分离株与基因重组型MDPV上海分离株SAAS-SHNH相似,可能为MDPV和GPV基因重组型水禽细小病毒。
分类号: S852.65
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