玉米线粒体基因组密码子偏好性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 侯梦薇

作者： 侯梦薇;汪文睿;曹言勇;吴晓林;李会勇

作者机构：

关键词： 玉米亚种NB;线粒体基因组;密码子偏好性;最优密码子

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2025 年 23 卷 011 期

页码： 3532-3539

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究玉米(Zea mays)线粒体基因组的密码子偏好性，本研究以玉米亚种NB线粒体基因组为例，筛选出155条编码基因序列，通过生物信息学方法分析其密码子的使用模式。结果显示，玉米亚种NB线粒体基因组所编码基因密码子的GC含量与第一、第二和第三各位点的GC含量均小于50%(GC1, GC2, GC3)，表明玉米亚种NB线粒体编码基因富含A和T碱基；有效密码子数(effective number of codons, Nc)与GC、GC1、GC2、GC3、GC3s均正相关；相对同义密码子使用频率(RSCU)>1的同义密码子共有28个，其中仅有3个以G/C结尾，表明密码子的第3位碱基使用偏好于A/T；中性绘图和Nc-plot分析发现选择压力可能是导致玉米线粒体基因组密码子使用模式之间差异的主要原因；最终通过高表达优越密码子方法确定了TTT、TTA、CTC等17个最优密码子，其中以A/T碱基结尾的最优密码子有12个。本研究结果有助于更好地了解玉米线粒体基因组密码子偏好性规律，为提高外源基因在线粒体中的表达效率提供了科学依据。

分类号： S513

  • 相关文献

[1]普通野生稻线粒体蛋白质编码基因密码子使用偏好性的分析. . 2019

[2]茄腐镰孢(Fusarium solani)线粒体基因组密码子偏好性分析. 李秀璋,宋辉,李春杰. 2015

[3]籽粒苋叶绿体基因组密码子偏好性分析. 冯瑞云,梅超,王慧杰,雷梦林,田翔,侯雅静. 2019

[4]扁蓿豆叶绿体基因组密码子偏好性分析. 田春育,武自念,李贤松,李志勇. 2021

[5]菠萝密码子使用偏好性分析. 陈哲,胡福初,王祥和,范鸿雁,张治礼. 2017

[6]高产小粒咖啡叶绿体基因组密码子偏好性分析. 李亚麒,严炜,娄予强,黄家雄,胡发广,付兴飞,李亚男,程金焕. 2023

[7]复羽叶栾树叶绿体基因组密码子偏好性分析. 肖明昆,聂恺宏,沈绍斌,刘倩,段春芳,李月仙,张林辉. 2023

[8]芒果叶绿体基因组密码子使用偏好性分析. 唐玉娟,赵英,黄国弟,付海天,宋恩亮,李日旺,金刚. 2021

[9]冬凤兰叶绿体基因组密码子使用偏好性分析. 晋宇轩,杜致辉,杨澜,石乐娟,陈之林. 2023

[10]小粒咖啡铁皮卡叶绿体基因组密码子偏好性分析. 李亚麒,黄家雄,娄予强,付兴飞,王健敏,李亚男,吕玉兰,李贵平,程金焕. 2023

[11]草菇密码子偏好性分析. 蒋玮,吕贝贝,何建华,王金斌,吴潇,武国干,鲍大鹏,陈明杰,张劲松. 2014

[12]高山松叶绿体基因组密码子偏好性模式. 李江飞,李亚麒,唐军荣,陈诗,陈林,蔡年辉,许玉兰,唐红燕. 2023

[13]尖孢镰刀菌全基因组密码子偏好性及特征分析. 路景诗,赵远征,王东,李晓杰,彭静文,张龙梅,张晓明. 2022

[14]基于RNA-Seq的莲雾密码子偏好性分析. 胡福初,陈哲,郭利军,罗志文,陈业光,范鸿雁,王祥和. 2017

[15]霸王密码子偏好性分析. 吉德娟,王占林. 2023

[16]云南樟叶绿体基因组密码子偏好性分析. 肖明昆,严炜,熊贤坤,沈绍斌,宋记明,易怀锋,张林辉. 2022

[17]香蕉基因组密码子使用偏好性分析. 黄羽,卢江,魏征,尹玲. 2017

[18]'白毫早'叶绿体与线粒体基因组密码子偏好性分析. 曾文娟,刘珊,文聪,张其湘,黄静,龚意辉,陈致印. 2025

[19]长囊水云叶绿体基因组密码子使用特征分析. 刘福利,王飞久,邵展茹. 2012

[20]木薯叶绿体基因组密码子偏好性分析. 赵英,付海天,金刚,徐钏,宋恩亮,罗燕春,莫永龙. 2022

作者其他论文 更多>>

微信小程序