基于转录组测序的铁皮石斛黄酮代谢途径及相关基因解析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 林江波
作者: 林江波;王伟英;邹晖;戴艺民
作者机构:
关键词: 铁皮石斛;转录组;黄酮;功能注释;表达;代谢
期刊名称: 福建农业学报
ISSN: 1008-0384
年卷期: 2019 年 09 期
页码: 1019-1025
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】分析铁皮石斛Dendrobium officinale黄酮类化合物的生物合成途径及相关基因,为铁皮石斛黄酮类化合物代谢调控、药用价值的开发研究提供参考。【方法】利用Illumina HiSeq 4000测序平台对铁皮石斛2个生长阶段茎、叶进行高通量转录组测序,对组装获得的unigenes进行功能注释和黄酮类化合物的生物合成相关基因解析。【结果】铁皮石斛黄酮类化合物代谢相关Unigenes 48个,涉及14个酶。5个CHS相关Unigenes具有CHSlike保守结构域,活性位点氨基酸残基(Cys-His-Asn)高度保守,丙二酰辅酶A结合位点和产物结合位点的部分氨基酸残基发生变异。CHI(Unigene0013781)属于类型I查尔酮异构酶,异构化6′-羟基查尔酮为5-羟基黄烷酮。表达分析表明,2个生长时期的茎和叶,CHS(Unigene0008250)、 CHI(Unigene0013781)和F3H的表达量都高于CHS(Unigene0012884)和C3′H。【结论】通过对转录组数据分析,共获得铁皮石斛黄酮类化合物代谢相关Unigenes48个,涉及14个酶;5个CHS相关Unigenes中,2个编码查尔酮合酶,3个编码联苄合酶;CHI(Unigene0013781)属于类型I查尔酮异构酶。
分类号: S567.239
- 相关文献
[1]基于转录组测序的铁皮石斛植物甾醇生物合成相关基因分析. 林江波,王伟英,邹晖,戴艺民. 2019
[2]基于RNA-Seq的辣木叶转录组研究. 张雅玲,王小安,潘少霖,叶新福. 2017
[3]青梗花椰菜和白梗花椰菜转录组分析. 林珲,薛珠政,李永平,李大忠,刘建汀,朱海生,温庆放. 2018
[4]基于转录组测序的紫色秋葵花青素合成相关基因研究. 张少平,应璐,邱珊莲,张帅,洪建基,郑开斌,余文权. 2018
[5]溪黄草转录组测序及生物信息学分析. 王继华,蔡时可,梅瑜,李汉章,杨少海. 2020
[6]8个番石榴品种的转录组测序. 张丽梅,陈钟佃,张朝坤,魏秀清,许家辉. 2021
[7]张溪香芋转录组测序及生物信息学分析. 王继华,罗群胜,梅瑜,杨少海. 2020
[8]芒果果实转录组数据组装及基因功能注释. 武红霞,许文天,罗纯,姚全胜,王松标,马小卫,詹儒林. 2016
[9]中泰南五味子转录组测序及生物信息学分析. 李静宇,徐友阳,蔡时可,王继华. 2022
[10]黄秋葵花和果荚转录组测序及类黄酮代谢差异表达分析. 姚运法,张少平,练冬梅,赖正锋,黄慧明,洪建基. 2018
[11]金毛狗转录组测序及生物信息学分析. 蔡时可,梅瑜,陈炜玲,史广生,李静宇,王继华. 2022
[12]紫背天葵高通量转录组测序分析. 张少平,洪建基,邱珊莲,郑云云,张帅,吴松海,何炎森,郑开斌,郑加协. 2016
[13]鸟巢蕨转录组高通量测序及分析. 贾新平,孙晓波,邓衍明,梁丽建,叶晓青. 2014
[14]显齿蛇葡萄转录组测序、注释与分析. 徐友阳,王德勤,李静宇,梅瑜,王继华,蔡时可. 2022
[15]基于高通量测序的建兰转录组信息分析. 樊荣辉,林兵,吴建设,钟淮钦. 2023
[16]椰子织蛾转录组分析. 徐志文,任雪敏,王俊,张枝全,刘乃勇,阎伟,朱家颖. 2018
[17]独脚金转录组特征分析. 张龙,蔡时可,孙金锴,梅瑜,王继华. 2023
[18]松萝凤梨转录组测序分析. 金亮,田丹青,詹书侠,安霞,葛亚英,王炜勇. 2019
[19]不同仿野生栽培铁皮石斛多品质指标的比较. 徐丽红,周鑫,郑蔚然,黎天天,何中方,詹福云,白丽萍,王君虹. 2018
[20]铁皮石斛的黄酮类成分测定及其生物可及性研究. 孙凤婷,许振岚,朱作艺,张春荣,汤涛,赵学平,盛清,王强. 2023
作者其他论文 更多>>
-
金线莲ArLBD1基因克隆、亚细胞定位及表达分析
作者:林江波;黄惠明;邹晖;李和平;戴艺民
关键词:金线莲;ArLBD1;亚细胞定位;基因克隆;原核表达
-
福建6个香牙蕉品种(品系)后熟过程中挥发性风味成分的变化
作者:张帅;吴水金;林宝妹;李海明;吴妙鸿;戴艺民
关键词:香牙蕉;后熟;挥发性风味成分;主成分分析;相对气味活度值
-
米根霉菌纤维素酶活性及其对农田废弃物的降解效果
作者:王伟英;柯叶鑫;李鸿浩;肖顺;王宗华
关键词:米根霉;农业废弃物;纤维素酶;酶活力;发酵
-
金线莲磷酸甘露糖变位酶基因的克隆与表达分析
作者:李和平;林江波;黄惠明;邹晖;戴艺民
关键词:金线莲;磷酸甘露糖变位酶(PMM);基因克隆;亚细胞定位;表达调控
-
金线莲资源遗传多样性分析及耐热性评价
作者:李和平;张树河;林江波;邹晖;戴艺民
关键词:金线莲;SCoT;遗传多样性;耐热性
-
转录组和代谢组分析瘤菌根菌对铁皮石斛的促生机制
作者:王伟英;林江波;邹晖;戴艺民
关键词:铁皮石斛;内生真菌;转录组;代谢组
-
5个不同品系迷迭香精油对金线莲尖孢镰刀菌的抑菌活性及GC-MS成分分析
作者:李珊珊;邹晖;杨敏;林江波;戴艺民;吴维坚
关键词:精油;尖孢镰刀菌;迷迭香;抑菌活性