中国明对虾FBA基因克隆及其在白斑综合征病毒感染中的表达及功能分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 史晓丽
作者: 史晓丽;孟宪红;孔杰;栾生;罗坤;曹宝祥;曹家旺;陈宝龙
作者机构:
关键词: 中国明对虾;FBA基因;基因克隆;组织表达;基因干扰
期刊名称: 渔业科学进展
ISSN: 2095-9869
年卷期: 2018 年 02 期
页码: 112-119
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 醛缩酶(FBA)是糖酵解和糖异生中的关键酶,参与多种生物过程。本研究采用RACE技术,克隆获得中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)FBA基因(Fc FBA)的全长c DNA序列,并对其进行生物信息学分析。结果显示,中国明对虾Fc FBA基因的c DNA全长为2496 bp,其中,ORF长1098 bp,5~′UTR长79 bp,3~′UTR长1319 bp。完整的阅读框编码365个氨基酸,分子量为39.8 k Da,预测的理论等电点为6.6。同源性及系统进化分析表明,Fc FBA与节肢动物的FBA聚为一类,与卤虫(Artemia franciscana)、家蚕(Bombyx mori)、沙漠蝗(Schistocerca gregaria)的相似度分别是86%、79%和78%。荧光定量PCR结果显示,Fc FBA在肌肉中的相对表达量最高,肝胰腺中最低。WSSV感染后,该基因在鳃、肝胰腺和肌肉中呈现出不同的时空表达特点。ds RNA干扰24 h以后,抑制效率达到最大。与PBS对照组相比,Fc FBA干扰组(ds RNA组)加快了对虾染病后的死亡速度。本研究表明,Fc FBA基因可能参与了中国明对虾生物胁迫的应答反应。
分类号: S945.46
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