美仁牦牛PHB基因克隆及组织表达

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨国武

作者： 杨国武;王佟;马小勇;扎老;路建卫;赵雪;阎萍;梁春年

作者机构：

关键词： 美仁牦牛;PHB基因;克隆;生物信息学;表达谱

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2023 年 005 期

页码： 218-226

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究美仁牦牛抗增殖蛋白（PHB）的结构及功能，并探究其在7日龄牛和成年牛的各组织中的表达情况。以美仁牦牛肾脏组织cDNA为模板克隆美仁牦牛PHB基因序列。对基因序列进行生物信息学分析以及对蛋白质进行理化性质预测，实时荧光定量PCR（RT-qPCR）技术检测PHB基因在美仁牦牛2个年龄段8个组织中的相对表达量。结果表明，美仁牦牛PHB基因的CDS区全长819 bp,共编码272个氨基酸；同源性比对发现美仁牦牛与普通牛的同源性最高（99.1%）;美仁牦牛PHB蛋白分析显示，PHB蛋白内存在1个N-糖基化潜在位点和2个O-糖基化潜在位点，其氨基酸等电点为5.55,不稳定系数（Ⅱ）为46.07,总平均疏水性为0.045,预测为不稳定疏水性蛋白质；亚细胞定位显示，PHB蛋白位于线粒体（30.4%）,蛋白内共有潜在磷酸化位点15个，PHB蛋白高级结构由α-螺旋（56.25%）、无规则卷曲（22.43%）、延伸链（16.54%）和β-转角（4.78%）相互连接而成。RT-qPCR结果显示，美仁牦牛2个发育阶段的8个组织中均有PHB基因的表达。在对比2个时期的PHB基因组织表达规律后发现，7个组织的PHB基因表达量随美仁牦牛的生长发育而降低，在美仁牦牛肝脏、脾脏、肺脏、脂肪和睾丸组织中，PHB基因表达量随年龄显著降低（P＜0.05）。

分类号： S823.85

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