3种DNA提取方法对养殖池塘不同生境菌群PCR-DGGE分析的影响

文献类型： 中文期刊

第一作者： 何夙旭

作者： 何夙旭;周志刚;姚斌;白东清

作者机构：

关键词： 养殖池塘;菌群;PCR-DGGE

期刊名称： 饲用酶制剂开发与应用技术交流研讨会论文集

ISSN：

年卷期： 2010 年

页码： 7

收录情况： CSCD

摘要： 比较3种DNA提取方法(溶菌酶法、CTAB法及珠磨法)对养殖池塘几种生境(底泥、饲料、草鱼肠道内容物及肠道壁)菌群PCR-DGGE分析的影响。结果表明,以3种提取方法获得的DNA为模板均能进行16SrDNAV3区特异性片段扩增;但不同DNA提取方法对池塘不同生境菌群DGGE指纹图谱存在显著影响。DGGE指纹图谱显示草鱼肠道内容物菌群(溶菌酶法)与肠道壁菌群(溶菌酶法)存在较高一致性,底泥菌群(CTAB法)及饲料菌群(溶菌酶法)与鱼体肠道菌群(包括内容物菌群和肠道壁菌群)则存在明显差异,但肠道菌群与底泥菌群的相似度相对更高。研究提示采用微生物分子生态学工具对养殖池塘不同生境进行菌群结构分析时,...

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