牦牛SRSF10基因克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李歆怡

作者： 李歆怡;黄纯;马晓明;喇永福;郭宪;阎萍;潘和平;梁春年

作者机构：

关键词： 美仁牦牛;SRSF10基因;生物信息学;脂肪

期刊名称： 中国草食动物科学

ISSN： 2095-3887

年卷期： 2022 年 42 卷 005 期

页码： 1-8

摘要： 为研究牦牛SRSF10(Serine/argnine-rich splicing factor 10,SRSF10)基因的结构及功能,以美仁牦牛脂肪组织cDNA为模板,克隆牦牛SRSF10基因的编码区(Coding sequence,CDS)序列,并利用基因序列进行生物信息学分析及蛋白理化性质预测.结果表明,美仁牦牛SRSF10基因的CDS区全长789 bp,共编码262个氨基酸;同源性比对发现,牦牛与野牦牛、黄牛之间的SRSF10基因亲缘关系最近(100%),与北极狐最远(97%);牦牛SRSF10蛋白分析显示,SRSF10蛋白内存在2个糖基化位点,1个RRM结构域(74 aa),无跨膜结构域及信号肽区域,其氨基酸等电点11.26,不稳定系数(Ⅱ)101.36,GRAVY=-1.762,预测为稳定的亲水性分泌蛋白;亚细胞定位与核定位预测分析均显示,SRSF10位于细胞核(61.9%),蛋白内共有潜在磷酸化位点63个;SRSF10蛋白高级结构由无规则卷曲(58.02%)、α-螺旋(21.76%)、延伸链(10.69%)和β-转角(9.54%)相互连接而成,主要与同为丝氨酸和富含精氨酸剪接因子、RNA结合蛋白等相关蛋白相互作用.综上所述,SRSF10基因在牦牛脂肪组织中发挥重要作用,该研究结果可为SRSF10基因在牦牛脂肪沉积调控机制的研究提供理论依据,也可为牦牛的遗传育种提供参考.

分类号： S823.2

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