苦茶槭嫩芽生长阶段RT-qPCR内参基因筛选及验证
文献类型: 中文期刊
第一作者: 焦小雨
作者: 焦小雨;吴琼;王文杰
作者机构:
关键词: 苦茶槭;嫩芽;内参基因;实时荧光定量反转录PCR;表达分析
期刊名称: 植物生理学报
ISSN: 2095-1108
年卷期: 2025 年 61 卷 008 期
页码: 1097-1108
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 苦茶槭的幼嫩芽叶经加工制成的“高茶(皋茶)”是一种代用茶饮,富含多种对健康有益的成分。为了解苦茶槭嫩芽生长过程中有效成分合成相关基因的表达水平,需要筛选稳定表达的内参基因,以提高分析结果的准确性。本研究基于苦茶槭嫩芽生长阶段的转录组数据,初步筛选出9个候选内参基因,通过RT-qPCR技术检测候选内参基因的表达量,并利用3种常用软件(geNorm、NormFinder和BestKeeper)以及RefFinder在线工具对候选内参基因的表达稳定性进行评价,选用类黄酮合成相关基因对内参基因稳定性进行验证。RefFinder综合评估结果显示, TUA、PP2A和ACT2的表达较为稳定,而SAND在所有候选内参基因中始终排名最低,稳定性最差。内参稳定性验证结果表明, TUA、PP2A、ACT2及其组合适宜作为内参基因用于苦茶槭嫩芽中基因表达研究,其中, ACT2是较好的选择。本研究结果为在苦茶槭中开展基因表达分析和功能研究奠定了基础。
分类号: S571.1
- 相关文献
[1]枣树内参基因ZjH3的克隆与筛选. 孟玉平,曹秋芬,孙海峰. 2010
[2]花椰菜BobACT基因的克隆及其作为内参基因的研究. 林珲,朱海生,温庆放,黄丽芳. 2019
[3]美洲南瓜α-微管蛋白CpTUA基因的分离及其作为内参基因的应用. 朱海生,刘建汀,温文旭,叶新如,王彬,李永平,陈敏氡,林珲,温庆放. 2018
[4]印度南瓜延伸因子基因CmEF1a的克隆与分析. 朱海生,刘建汀,温文旭,李永平,王彬,陈敏氡,温庆放. 2019
[5]牡丹泛素延伸蛋白基因ubiquitin的克隆及其作为内参基因的研究. 刘传娇,王顺利,薛璟祺,朱富勇,任秀霞,李名扬,张秀新. 2015
[6]火龙果溃疡病菌实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 姚姿婷,曹雪颖,肖雪,李瑞芳,韦小妹,邹承武,朱桂宁. 2023
[7]百合肌动蛋白基因lilyActin的克隆与表达分析. 梁云,袁素霞,冯慧颖,徐雷锋,袁迎迎,刘春,明军. 2013
[8]西葫芦CpActin内参基因的分离及其作为内参基因的初步应用. 刘建汀,朱海生,王彬,李永平,陈敏氡,张前荣,温庆放. 2019
[9]超低温保存前处理甜橙嫩芽再生培养基的筛选. 刘英,李中安. 2012
[10]不同杀青方式对多花黄精嫩芽茶品质的影响. 马佳丽,张厅,赵文慧,刘运腾,张一弛,马泽强,王成,王剑波. 2024
[11]瓷玫瑰的组织培养. 文慧婷,张翠玲. 2006
[12]天门冬组织培养研究. 杨平飞,罗鸣,刘海,宋智琴,张金霞,赵仕娟,赵明书,吴明开. 2019
[13]枣树发出的嫩芽为何不见了. 李夏鸣,胡增丽. 2007
[14]灰毡毛忍冬内参基因筛选和Mads-box家族基因AGL15的时空表达分析. 朱贻霖,谢舒平,陈林,欧阳琳,刘峰,张亚丽,刘湘丹,童巧珍. 2016
[15]湖羊小肠黏膜内参基因筛选. 马志远,翁秀秀,李飞,李发弟,王维民,刘婷. 2015
[16]利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件进行内参基因稳定性分析的方法. 吴建阳,何冰,杜玉洁,李伟才,魏永赞. 2017
[17]印度谷螟实时荧光定量PCR内参基因的选择. 唐培安,张棋麟,薛昊,袁明龙. 2016
[18]猪骨骼肌荧光定量PCR内参基因稳定性分析. 齐富磊,林勇,杨铭洋,邓康泥,黄媛琴,徐稳,周小兵,丁沛,贾逸敏. 2020
[19]尖裸鲤实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 孙海成,吕晓楠,佟广香,尹家胜,薛淑群,张丽娜,韩英. 2019
[20]民猪外周血单核细胞实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 马红,刘宇,汪亮,王文涛,吴赛辉,何鑫淼,刘娣. 2017
作者其他论文 更多>>
-
茶树CsWAK8克隆及其在响应冷胁迫过程中的功能分析
作者:焦小雨;吴琼;刘丹丹;孙明慧;阮旭;王雷刚;王文杰
关键词:茶树;细胞壁关联蛋白激酶(WAK);基因克隆;功能验证;冷胁迫
-
基于数字PCR方法的玉米内标准基因比较研究
作者:齐鑫;李欣然;郭亚宁;王丹;李凯;吴琼;李亮
关键词:转基因玉米;转基因检测;内标准基因;数字PCR
-
茶树醛脱氢酶(ALDH)超家族的鉴定与表达分析
作者:刘丹丹;王雷刚;孙明慧;焦小雨;阮旭;吴琼;王文杰
关键词:茶树;醛脱氢酶;全基因组鉴定;系统进化;非生物胁迫
-
茶树BURP基因家族全基因组鉴定与表达分析
作者:孙明慧;刘丹丹;吴琼;焦小雨;王文杰
关键词:BURP基因家族;茶树;基因表达;非生物胁迫;全基因组鉴定
-
海南地方品系三江大蕉糖酸组分和含量分析
作者:孙长君;郭素霞;程志号;曾学蔚;吴琼
关键词:三江大蕉;高效液相色谱;糖酸组分;糖酸含量;糖酸比
-
茶学专业生物信息学课程教学探索与实践
作者:童伟;李方东;高琪娟;吴琼;夏恩华
关键词:茶学;生物信息学;课程设立;课程教学改革
-
推动农业科研院所党建与科研融合发展的实践与思考-以北京市农林科学院智能装备技术研究中心为例
作者:吴琼;尹鸣;韩小晶;张博
关键词:农业科研院所;党建工作;科研工作;融合发展
