180日龄文昌鸡和隐性白羽克洛鸡基因结构及SNP分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 顾丽红

作者： 顾丽红;刘志勇;张细权;邱峰芳;邢增杨;赵建国;林哲敏

作者机构：

关键词： 文昌鸡;RNA测序;可变剪接;单核苷酸多态性;新转录本

期刊名称： 畜牧与兽医

ISSN： 0529-5130

年卷期： 2019 年 03 期

页码： 7-15

收录情况： 北大核心

摘要： 采用生物信息学的方法对180日龄文昌鸡和隐性白羽克洛鸡RNA-Seq的94 614 632的Clean Reads进行了单核苷酸多态性(SNP)的查找、可变剪接筛查、基因结构优化和新转录本预测。结果共得到可靠的SNP位点220 308个,可变剪接56 119个,优化了21 633个基因,预测到1 235个新转录本。本研究结果能够进一步完善鸡基因组注释情况并丰富鸡SNP数据库和可变剪切数据库。

分类号： S831.2

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