猪嵴病毒非结构蛋白2C的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈秋勇

作者： 陈秋勇;胡崇伟;陈如敬;陈晓珞;林群群;陈鹏强;修金生

作者机构：

关键词： 猪嵴病毒;非结构蛋白2C;生物信息学分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2014 年 41 卷 11 期

页码： 50-54

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究运用RT-PCR方法从猪嵴病毒感染阳性样品中扩增出其非结构蛋白2C全基因,并将其克隆到T载体后进行序列测定。研究结果表明,猪嵴病毒非结构蛋白2C全长为1005bp,编码335个氨基酸。所编的非结构蛋白2C大小为36.9297ku,理论等电点为7.18;不稳定系数为39.41,属于稳定蛋白质类;脂肪族氨基酸指数为87.10,平均亲水性为-0.242。与其核苷酸同源性最高的是CH/HZ/2011株(GenBank登录号:JX827598),同源性为91.6%;同源性最低的是XX株(GenBank登录号:KC204684),同源性为88.8%。遗传进化分析结果显示,猪嵴病毒非结构蛋白2C在遗传进化树呈3个明显的结构分支,猪源嵴病毒匈牙利株和泰国株处于第Ⅲ遗传进化分支,猪嵴病毒中国分离株分处于第Ⅰ和第Ⅱ遗传进化分支,呈一定的区域流行性。

分类号： S852.65

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