基于高通量测序的福安刺葡萄基因组初步研究
文献类型: 中文期刊
第一作者: 陈婷
作者: 陈婷;周平;刘鑫铭;蔡盛华;雷龑
作者机构:
关键词: 高通量测序;福安刺葡萄;基因组
期刊名称: 福建农业学报
ISSN: 1008-0384
年卷期: 2017 年 32 卷 02 期
页码: 134-137
收录情况: 北大核心
摘要: 为进一步了解福建福安刺葡萄的遗传背景,寻找刺葡萄与欧亚种葡萄之间的遗传差异,本研究基于高通量测序技术展开对福安刺葡萄基因组的分析,共得到测序数据8.4Gb,鉴定出3 192 484处非冗余遗传差异。差异位点分布位置结果显示,30.34%的差异位于基因间区,3.67%的差异位于基因外显子区。通过对比葡萄参考基因组序列,共鉴定出刺葡萄基因组上存在1 863 237个同源SNP、1 244 590个异源SNP位点,表明本次测序所用的福安刺葡萄有可能是异源二倍体。
分类号: S661.2
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