枇杷果实坐果前后差异基因筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 任燕

作者： 任燕;张学英;安海山;徐芳杰;蒋爽

作者机构：

关键词： 枇杷;转录组测序;膨大基因;开闭萼

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 18 卷 024 期

页码： 8022-8029

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 枇杷(Eriobotryajaponica)在坐果前后,小果花萼由开放状态转为闭合状态.为获得这一过程中促进果实发育膨大的相关基因,本研究以'火炬'、'田中'和'白玉'开萼和闭萼的果实为试验材料,进行转录组测序分析.共获取40 Gb测序数据,每个样本的数据量在6.67~6.88 Gb之间,平均为6.75 Gb.对测序数据进行重头拼接后获得37 129个Unigene.分离鉴定到了518个共性差异表达基因.根据注释信息筛选出16个基因可能与枇杷开闭萼前后促进果实发育有关.其中包括6大类:WOX基因、赤霉素相关基因、生长素结合蛋白相关基因、扩张蛋白基因、脱落酸相关基因和乙烯相关基因.前4类与细胞分裂和增大直接相关,在坐果后发生显著上调表达.后2类中脱落酸和乙烯均与落果有关,在授粉后,这些基因被显著抑制.每个大类选择1~2个基因进行荧光定量验证,结果显示这些基因的荧光定量结果和转录组的FPKM值趋势吻合.该研究为枇杷坐果提供重要的分子理论指导,相关的差异基因的挖掘有助于枇杷坐果的分子机制解析.

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