柞蚕蛹全长cDNA文库的构建和随机EST测序

文献类型： 中文期刊

第一作者： 夏润玺

作者： 夏润玺;李玉萍;王欢;李喜升;刘彦群;秦利;姜德富;鲁成

作者机构：

关键词： 柞蚕;cDNA文库;RNA转录5′末端转换;表达序列标签;延伸因子-1α(EF-1α)

期刊名称： 蚕业科学

ISSN： 0257-4799

年卷期： 2009 年 35 卷 03 期

页码： 74-78

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用RNA转录5′末端转换(SMART)技术构建了柞蚕(Antheraea pernyi)蛹的全长cDNA文库。所构建cDNA文库的容量为5×105个独立克隆,插入片段长800~2500 bp,且90%的插入片段大于1 kb。随机挑取288个克隆进行表达序列标签(EST)测序,有效序列为250条,根据EST测序结果计算文库重组率达95%。经序列拼接得到175个unigenes,通过序列比对发现其中97个unigenes与GenBank中的已知基因高度同源,且有88条全长序列,基因的完整性比率达90%。在随机EST测序中获得了具有5′端和3′端非编码区的延伸因子-1α基因(Gen-Bank登录号:FJ788508),该基因cDNA全长1743 bp,有一个1392 bp的开放阅读框,编码含463个氨基酸残基的蛋白,蛋白的理论分子质量为50.4 kD,等电点8.96。EST测序分析表明,柞蚕蛹cDNA文库符合构建基因文库的质量要求,该文库的构建将有助于柞蚕功能基因的克隆和研究。

分类号： Q78

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