猕猴桃BBX基因家族成员鉴定与转录特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 路喻丹

作者： 路喻丹;刘晓驰;冯新;陈桂信;陈义挺

作者机构：

关键词： 猕猴桃;BBX转录因子;全基因组鉴定;不同组织部位;果实贮藏;转录分析

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2024 年 40 卷 002 期

页码： 172-182

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]BBX(B-Box)作为锌指转录因子亚家族之一,广泛参与植物的生长发育过程.本研究旨在揭示猕猴桃BBX家族的基因特征和潜在功能.[方法]从全基因组水平对猕猴桃BBX基因家族进行鉴定,分析其蛋白质理化性质、亚细胞定位、系统发育特征、蛋白质保守结构域以及同源特性等,同时研究它们在不同组织部位和果实贮藏过程的表达模式.[结果]48 个AcBBX不均匀地分布于 22 条染色体上,编码的氨基酸长度 126-515 aa,蛋白分子量 14172.09-57905.84 Da,预测有 4 种亚细胞定位;家族成员有 0-4 个内含子;启动子含有光反应、植物激素调控、逆境胁迫调控、生长发育调控等多种顺式作用元件.结合进化树及保守结构域被聚为 5 个组,基因串联重复和片段复制是家族成员扩张的主要原因.AcBBXs在猕猴桃不同器官中的表达量有差异,7 个成员在成熟果中表达量较其他部位高,3 个成员在幼果中表达较高,7 个成员在叶中表达量较高,3 个成员在花中表达量较高;果实采后贮藏过程中,3 个成员受果实外源激素调控影响表达上调且高于其他处理组,6 个成员在果实室温贮藏一周后表达上调且高于其他处理组.在果实4℃低温贮藏过程中,10个成员的表达随时间增加而上调,5个成员的表达随时间增加而下调.[结论]揭示了BBX家族不同成员在猕猴桃生长发育和果实采后贮藏期间的转录特征,为后续猕猴桃BBX基因功能验证奠定基础.

分类号：

  • 相关文献

[1]猕猴桃蔗糖合成相关酶SUS与SPS基因的鉴定与表达分析. 刘春晓,蔡恒,张涛,朱海军,钱亚明. 2024

[2]猕猴桃过氧化氢酶基因家族全基因组鉴定与表达分析. 赖瑞联,冯新,高敏霞,路喻丹,刘晓驰,吴如健,陈义挺. 2023

[3]十月果园农事. 李岩,张承安. 1996

[4]采收期对红香酥梨果实贮藏品质的影响. 王志华. 2016

[5]恩诺沙星对大肠杆菌全基因组表达谱的影响. 白华,齐静,朱小玲,王庆艳,杜加法,刘玉庆. 2009

[6]凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)Runt转录因子的基因克隆及其功能分析. 王晓雯,梁艳,邢婧,刘旭雅,黄倢. 2014

[7]稻属中一个高度保守和组成型表达酪氨酸/丝氨酸-酸酸双特性蛋白激酶基因的克隆与分析(英文). 杨明挚,黄兴奇,张汉波,陈善娜,杨红玉,程在全. 2009

[8]家蚕浓核病毒BmDNV-3(中国株)VD_1基因组结构与转录分析. 王永杰,姚勤,陈克平,韩序. 2006

[9]家蚕丝氨酸蛋白酶基因BmSPH33对BmNPV诱导的免疫响应. 张永红,邵榆岚,苏振国,白兴荣. 2021

[10]家蚕δ-鸟氨酸转氨酶基因Bmoat转录分析及对免疫的响应. 张永红,朱峰,唐芬芬,邵榆岚,白兴荣. 2018

[11]太平猴魁茶栽培品种‘柿大茶’品系间代谢物及遗传进化分析. 周汉琛,刘亚芹,王辉,杨霁虹,徐玉婕,雷攀登. 2023

[12]弱光环境下适应性不同的番茄生长发育与转录组差异分析. 王虹,苗辰,丁小涛,沈海斌,朱为民. 2024

[13]猪圆环病毒2型SD2分离株ORF3基因转录分析. 丁鹏,李俊,于周,程凯慧,吴家强,王金宝. 2009

[14]类猪圆环病毒P1转录的Northern Blot分析. 温立斌,王凤芝,何孔旺,倪艳秀,张雪寒,李彬,王小敏,郭容利,周俊明,俞正玉,茅爱华,吕立新,解建平. 2014

[15]家蚕丝氨酸蛋白酶基因BmSP25转录分析及其免疫响应. 张永红,朱峰,唐芬芬,邵榆岚,白兴荣. 2017

[16]家蚕 δ-鸟氨酸转氨酶基因Bmoat转录分析 及对免疫的响应. 张永红,朱峰,唐芬芬,邵榆岚,白兴荣. 2018

[17]小麦几丁质酶基因家族的全基因组鉴定及禾谷镰刀菌胁迫下的表达分析. 徐武,刘建丰,张戈,徐文,袁祖丽. 2019

[18]辣椒BES1基因家族鉴定及表达分析. 孟纯阳,魏小春,赵艳艳,原玉香,王志勇,杨双娟,姜俊,张晓伟. 2019

[19]菜用大豆液泡膜内在蛋白(TIPs)基因鉴定及表达分析. 冯志娟,徐盛春,刘娜,张古文,胡齐赞,龚亚明. 2018

[20]大豆分枝相关CYC/TB1-Like(CYL)基因鉴定及菜用大豆品种的激素表达谱分析. 冯志娟,刘娜,张古文,徐盛春,龚亚明. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序