基于InDel标记的杏鲍菇遗传多样性评价

文献类型: 中文期刊

第一作者: 姜晓红

作者: 姜晓红;朱家漘;孙忠刚;曲绍轩;马林;李辉平

作者机构:

关键词: 杏鲍菇;基因组比对;分子标记;种质资源评价

期刊名称: 食药用菌

ISSN:

年卷期: 2023 年 006 期

页码: 385-390

摘要: 插入/缺失(insertion-deletion,InDel)标记作为快速鉴定品种间遗传多样性的方法之一,因具有对检测设备要求低、简单易行、成本低,且共显性遗传、变异稳定、准确性高、重复性好等特点,在医学、动植物遗传学的群体遗传分析、基因定位及遗传图谱构建等领域被广泛应用。为评价我国杏鲍菇菌株的遗传多样性,加快杏鲍菇遗传育种工作进程,通过比对杏鲍菇已公布的基因组组装数据,开发30~200 bp InDel标记便于常规电泳检测,随机选取合成36对引物对收集自国家食用菌标准菌株库、国内企业和市场的65份杏鲍菇菌株进行验证,筛选出25对有效引物,进行遗传多样性分析并构建UPGMA聚类树。结果表明,65份供试菌株遗传多样性丰富,遗传相似系数最低为0.362,在相似系数0.616时可分为5个类群。

分类号: S646

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