基于BSA-seq的番木瓜株高候选基因定位

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴夏明

作者： 吴夏明;周陈平;杨敏;徐泽;邝瑞彬;刘传和;贺涵;魏岳荣

作者机构：

关键词： 番木瓜;株高;BSA-seq;基因定位;候选基因

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2025 年 41 卷 009 期

页码： 54-61

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】株高是影响番木瓜产量和品质的重要性状之一，定位番木瓜株高的主要候选基因，为番木瓜的矮化育种提供基因资源。【方法】以YY（植株较高）和GM（植株较矮）为亲本构建定位群体，利用BSA-seq技术对两亲本以及子代混池GY-H（高池）和GY-S（矮池）进行测序分析，数据经质控后，利用ED以及SNP-index法计算混池之间的基因频率差距，定位番木瓜株高候选区间。【结果】本次BSA-seq产生的数据良好，数据经过滤后，最终得到高质量的SNP位点337 980个用于基因定位，利用ED以及SNP-index法计算寻找混池之间基因型频率的显著差异，最终分别在第3、6和8染色体上共定位到大小为0.93 Mb的候选区间，将该区间与番木瓜‘紫晖’参考基因组比对，0.93 Mb的区间内共包含46个编码基因，其中，有37个基因被注释。【结论】Cp＿zihui12764、Cp＿zihui06963、Cp＿zihui07024和Cp＿zihui12732可能是调控番木瓜株高的候选基因。

分类号： S667.9

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