亚洲棉(Gossypium arboreum L.)纤维次生壁加厚期NAC基因的鉴定与表达分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 王中娜

作者: 王中娜;商海红;陈婷婷;巩万奎;刘爱英;李俊文;石玉真;龚举武;葛群;王琳;李伟;李鹏涛;白志川;于杰;袁有禄

作者机构:

关键词: 亚洲棉(G.arboreum L.);棉纤维;NAC转录因子;序列分析;结构分析;表达模式

期刊名称: 棉花学报

ISSN: 1002-7807

年卷期: 2016 年 28 卷 01 期

页码: 52-64

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 基于亚洲棉29729条纤维相关EST(Expressed sequence tag)序列和亚洲棉基因组序列,并结合雷蒙德氏棉(G.raimondii)NAC(NAM/ATAF/CUC)转录因子家族的研究结果,利用生物信息学方法,鉴定出143个亚洲棉NAC转录因子家族基因;利用实时荧光定量PCR技术对30个NAC转录因子构建表达图谱,鉴定出7个基因在亚洲棉纤维细胞次生壁加厚期优势表达,进一步明确了它们在亚洲棉、雷蒙德氏棉和陆地棉中的表达模式差异。利用RT-PCR(Reverse transcription-polymerase chain reaction)技术克隆得到了3个NAC基因全长c DNA,将其命名为Ga NAC20、Ga NAC09和Ga NAC69,初步的生物信息学分析发现Ga NAC20和Ga NAC09基因均含有3个外显子和2个内含子,Ga NAC69含有4个外显子和3个内含子,为进一步研究奠定了良好基础。

分类号: S562

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