绿豆生长素响应因子基因家族序列特征及分子进化
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王彩萍
作者: 王彩萍;王丽;宋敏;刘荣华;孙朝霞;侯思宇
作者机构:
关键词: 绿豆;生长素响应因子;基因家族;系统进化
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2018 年 02 期
页码: 371-376
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 绿豆种子萌发率严重影响和制约其田间产量,研究利用与绿豆种子萌发相关的基因资源具有十分重要的意义。本研究拟通过查询绿豆转录组数据库,分离包含完整ORF的生长素响应因子(ARF)基因家族成员,对比分析该家族成员的蛋白保守结构域,基于氨基酸序列同源性构建系统进化树。结果表明:分离到22个包含完整ORF的ARF基因,其核苷酸序列长度范围为905~3 624 bp,其编码氨基酸序列长度的范围为237~761 aa。其中仅有4个ARF基因包含保守的B3 DNA结合结构域、Auxin响应因子和AUX/IAA家族蛋白结构域,其他基因存在1~2个保守结构域的缺失。系统进化树结果显示,绿豆22个ARF基因与拟南芥12个ARF基因共划分为3大类,9个亚类。这些结果为进一步揭示绿豆ARF基因功能多样性,同时为将来遗传工程改良绿豆品种提供理论参考。
分类号: Q943.2`S522
- 相关文献
[1]高粱糖转运蛋白基因家族全基因组鉴定、分类及表达分析. 徐志军,刘洋,徐磊,安东升. 2019
[2]陆地棉LTPG基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 吴翠翠,肖水平,夏芝,任文斌,任翔,张先亮. 2023
[3]全基因组水平金银花TCP基因家族的鉴定及表达模式分析. 谭政委,郭水柱,苏小雨,孙瑶,余永亮,李磊,张利超,许兰杰,鲁丹丹,安素妨,李春明,梁慧珍,王子君. 2024
[4]受棉铃虫诱导的棉花糖基转移酶UGT基因家族的生物信息学及表达分析. 玛依拉·玉素音,阳妮,徐海江,杨延龙,张大伟,李春平,石必显,赖成霞. 2023
[5]棉花SRS基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析. 张雪,孙瑞斌,马聪聪,马丹,张晓睿,刘志红,刘传亮. 2022
[6]花生生长素响应因子基因AhARF3的克隆与表达分析. 唐桂英,崔维佩,徐平丽,李鹏祥,朱洁琼,单雷. 2019
[7]香蕉MaARF2基因的克隆及序列表达分析. 黄东梅,许奕,吴斌,马伏宁,陈弟,李敬阳,林妃,宋顺. 2020
[8]蒺藜苜蓿miR167c调控生长和花器官发育的功能验证. 张立霞,李霄,许蕾,旦真措,刘亚娇,苏德毕力格,丛丽丽,杨青川,龙瑞才. 2023
[9]梅PmARF17克隆及其在花发育中与内源激素的调控模式. 李艳林,SHAHID Iqbal,侍婷,宋娟,倪照君,高志红. 2021
[10]生长素信号对植物侧根发育的调控. 朱振兴,李丹. 2015
[11]茶树生长素响应因子基因CsARF1的克隆与表达分析. 郝心愿,曹红利,杨亚军,王新超,马春雷,肖斌. 2013
[12]茄子生长素响应因子SmARF8的克隆与分析. 杜黎明,毛伟海,包崇来,胡天华,朱琴妹,胡海娇. 2009
[13]玉米生长素响应因子基因ZmARF10在干旱胁迫中的功能分析. 曹丽茹,叶飞宇,李伟亚,马晨晨,庞芸芸,梁小菡,张新,鲁晓民. 2024
[14]香蕉MaARF19-1基因的克隆及序列分析. 黄东梅,许奕,李敬阳,林妃,李艳霞,李羽佳,魏卿,宋顺. 2018
[15]苹果生长素响应因子(MdARF)基因克隆与表达分析. 李慧峰,张文芹,董庆龙,王小非,冉昆. 2018
[16]苹果生长素响应因子(ARF)基因家族全基因组鉴定及表达分析. 李慧峰,冉昆,何平,王海波,常源升,孙清荣,程来亮,李林光. 2015
[17]大豆KUP/HAK/KT钾转运体基因家族的鉴定与表达分析. 晁毛妮,温青玉,张晋玉,张志勇,董洁. 2017
[18]玉米FLA蛋白家族的生物信息学分析. 胡颖,陈亚波,宋群星. 2017
[19]葡萄miR159家族生物信息学分析及靶基因预测分析. 葛金涛,王丽丽,赵统利,刘兴满. 2018
[20]硬粒小麦Glu-B3基因家族新成员的克隆及其分子标记的开发. 赵永涛,孔秀英,詹克慧. 2008
作者其他论文 更多>>
-
鸡呼吸产热代谢的研究
作者:张建建;李平;蒋守群;王丽;杨雪芬;张赛
关键词:呼吸商;产热量;呼吸测热;开放回流呼吸测热装置
-
实现生猪低碳养殖的营养调控研究进展
作者:宋敏;邓盾;刘志昌;余苗;崔艺燕;马现永;卢钰升
关键词:生猪养殖;温室气体;低碳;饲料;营养调控;源头减排
-
蔬菜根系土壤硒镉含量与理化性质关系研究
作者:王丽;蒋亚;王迎康;刘桂华;柴冠群;范成五
关键词:土壤;蔬菜;全硒;全镉;理化性质
-
马铃薯在预制菜中的应用现状及存在问题和展望
作者:任路路;王丽;姜敏
关键词:预制菜;马铃薯;加工;品种
-
热应激对畜禽肠道微生物的影响研究进展
作者:熊云霞;易宏波;杨雪芬;王丽
关键词:热应激;肠道微生物;畜禽
-
2种双酰胺类杀虫剂对东方黏虫的室内生物活性测定及田间防效
作者:陈冉;高梦雪;雒珺瑜;王丽;朱香镇;张开心;李东阳;高雪珂;姬继超;崔金杰;马德英
关键词:东方黏虫;溴虫氟苯双酰胺;四唑虫酰胺;室内生物活性;田间药效
-
钾和镁在养猪生产中的应用及对肉品质的影响
作者:韩熙;崔百磊;肖昊;熊云霞;温晓鹿;王丽;杨雪芬;胡胜兰
关键词:钾镁元素;猪;生长性能;肉品质