民猪FoxN1基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李苓

作者： 李苓;张冬杰;汪亮;王鑫鑫;曹越;刘娣

作者机构：

关键词： 民猪;FoxN1基因;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2016 年 43 卷 04 期

页码： 928-933

收录情况： 北大核心

摘要： 试验旨在对民猪FoxN1基因的结构和功能进行初步探索。利用常规PCR技术对民猪FoxN1基因进行克隆,利用生物信息学手段对所获得FoxN1基因完整编码区序列进行分析,对民猪和大白猪的FoxN1基因序列进行比对,并构建分子进化树。结果显示,民猪FoxN1基因完整编码区长1 941bp,编码646个氨基酸,分子质量为68.64ku,理论等电点为5.81。FoxN1蛋白位于细胞核内,不存在信号肽,不是分泌性蛋白,不存在跨膜区,在第269—347氨基酸处有1个叉头结构域,该蛋白在不同的物种间有高度的保守性。克隆发现了3种转录剪切变异体,与变异体1相比,变异体2在第124—387核苷酸位置处发生缺失,变异体3在581—582处发生GCA插入。民猪与大白猪的FoxN1基因序列相比,存在4个突变位点,其中3个是同义突变,1个是错义突变,导致第108位的氨基酸发生了改变。由分子进化树得知,民猪与偶蹄目动物亲缘关系较近。上述结果表明FoxN1基因结构复杂,对其生物信息特性的探究将为进一步揭示民猪FoxN1基因的功能提供依据。

分类号： S828

  • 相关文献

[1]民猪FoxN1基因的表达规律及对低温应答反应. 张冬杰,李苓,王鑫鑫,汪亮,杨国伟,刘娣. 2017

[2]花生谷氨酸脱氢酶基因AhGDH1的克隆与生物信息学分析. 陈湘瑜,徐日荣,林栩松,唐兆秀. 2016

[3]灰毡毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克隆、生物信息学和表达分析. 蔡嘉洛,朱贻霖,陈林,樊悦,刘峰,张亚丽,欧阳琳,刘湘丹. 2016

[4]栽培种花生FAE1基因的克隆和序列分析. 张欣,孙全喜,吴琪,王秀贞,胡东青,唐月异,王志伟,宋国生,徐建志,殷冬梅,王传堂. 2018

[5]小偃麦异附加系TaXTH基因的克隆与生物信息学分析. 黄春丽,宋静,李全权,郭庆东,田秋菊,高居荣,王洪刚,封德顺. 2015

[6]小麦ent-柯巴基焦磷酸合酶基因TaCPS1的克隆与荧光定量分析. 郭庆东,李全权,田秋菊,钱艳丽,许田,杨艳林,王洪刚,封德顺. 2016

[7]菊花抗白色锈病相关基因CmDREBa-2的克隆及表达分析. 熊超明,赵兴华,贾红梅,延昕,毛洪玉. 2018

[8]杜仲BR受体蛋白基因EuBRI1克隆及生物信息学分析. 刘明月,赵懿琛,赵德刚. 2018

[9]芝麻抗裂蒴基因SiIND1的克隆与原核表达. 刘艳阳,武轲,梅鸿献,杜振伟,崔承齐,江晓林,郑永战. 2020

[10]苹果蠹蛾8个烟碱型乙酰胆碱受体基因的克隆与生物信息学分析. 罗嘉鹏,冯丽凯,李飞,林克剑,王桂荣. 2018

[11]菜用大豆蔗糖转运蛋白基因Glyma18g15950的克隆及生物信息学分析. 张玉梅,胡润芳,林国强. 2019

[12]野葛钙离子依赖性核酸酶PlCaN基因克隆和生物信息学分析. 郭坤元,林先明,何美军,郭汉玖. 2018

[13]玉米蔗糖转运蛋白基因ZmSUT3J的克隆及生物信息学分析. 李楠,朱旭,柳青,郭嘉,孙传波,李传龙,贺红利,贺红霞. 2021

[14]魔芋软腐病pelD和pelE基因的克隆与表达分析. 陈恩发,刘辉,丁海兵,潘牧,王启富. 2021

[15]菠菜SpNHX1基因的克隆及生物信息学分析. 张海洋,付娆,李茹霞,顾寅钰,梁晓艳,宋延静,李萌,王向誉,郭洪恩. 2019

[16]高粱转录因子基因SbSBP15的克隆及表达分析. 方远鹏,蒋君梅,杜巧丽,陈美晴,裴会敏,屈志广,任明见,谢鑫. 2020

[17]牦牛RETN基因克隆及组织表达分析. 侯孟典,王会,柴志欣,王吉坤,信金伟,姬秋梅,钟金城. 2019

[18]杜仲EuDREB1基因的克隆及生物信息学分析. 杨玲玲,王磊,赵德刚,赵懿琛. 2018

[19]高羊茅FaGST1基因克隆、亚细胞定位及表达分析. 陈锡,赵德刚,陈莹,吴佳海,袁暘暘,王小利. 2020

[20]香菇草酰乙酸水解酶基因LeOAH1克隆及表达分析. 段应策,胡姿仪,杨帆,李金涛,邬向丽,张瑞颖. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序