喀什地区部分鸽群新城疫病毒的检测及F基因片段序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈诒伟

作者： 陈诒伟;郭明强;张飞;米晓云;丁洁;付小龙;吾米提江·木合台尔;苏战强

作者机构：

关键词： 喀什地区;鸽;新城疫;新城疫病毒;检测;分析

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2023 年 020 期

页码： 96-100,142

收录情况： 北大核心

摘要： 为调查喀什地区鸽群新城疫病毒感染情况及流行毒株的分子流行病学特征，试验采集喀什地区部分鸽群中疑似新城疫病毒感染的病鸽口腔及泄殖腔拭子68份，首先采用胶体金检测法进行初筛，然后采用RT-PCR法对初筛阳性样品进行新城疫病毒F基因片段的检测，并将产物进行测序，接着采用qRT-PCR方法对RT-PCR结果进行验证，最后将测序结果进行BLAST比对、系统发育树构建、同源性分析和氨基酸序列分析。结果表明：68份样本中，有7份样本胶体金检测为阳性，有1份样本RT-PCR检测出目的条带，qRT-PCR检测结果与RT-PCR检测结果一致。测序结果经BLAST比对发现，阳性样本的F基因片段序列与NDV03-29毒株（GenBank登录号为DQ217694.1）和Behaira Equpt MR6 2012毒株（GenBank登录号为JX193771.1）的相似性最高，均为99.8%;经系统发育树构建和同源性分析发现，所检测到的毒株属于基因Ⅱ型，除了与Behaira Equpt MR6 2012和NDV03-029高度同源外，还与毒株La Sota（GenBank登录号为KU665482.1）的核苷酸相似性较高，与鸽源PPMV-1毒株Vladimir-687-05（GenBank登录号为JF824032.1）核苷酸相似性较低；氨基酸序列分析发现该毒株F0裂解位点的氨基酸序列为112GRQGRL117,与NDV弱毒株一致。说明喀什地区部分鸽群中存在基因Ⅱ型新城疫病毒弱毒株感染情况，在今后的养殖过程中需要进一步加强新城疫病毒的监测和防控。

分类号： S852.65

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