民猪低温胁迫的基因表达谱分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 杨月莹
作者: 杨月莹;刘娣;丁常宏;祁雪莲
作者机构:
关键词: 基因表达谱;目标优化;低温胁迫;特征选择
期刊名称: 江西农业大学学报
ISSN: 1000-2286
年卷期: 2013 年 35 卷 04 期
页码: 807-812
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 随着基因芯片在基因的发现与识别等研究方面的应用,高通量并行识别特征基因成为表达谱分析的重要工作之一。地方猪种民猪在抗寒性方面表现出较好的生物特征,提出的目标优化方法在识别民猪抗寒性状相关基因方面效果较好。通过制备常温状态和低温状态两类样本的基因芯片,获得了民猪低温胁迫的表达谱数据,通过目标优化算法多次迭代筛选得到的特征基因集合,对于不同的特征基因集合的分析,最终确定民猪抗寒性状相关基因,注释在生物学数据库中获得了相应的基因功能。目标优化算法泛化性能较好,能够同步进行特征基因的选择和样本分类两过程。
分类号: S828.2
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