棉花纤维发育相关基因表达谱的比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 于霁雯

作者： 于霁雯;翟红红;黄双领;李兴丽;张红卫;张金发;喻树迅

作者机构：

关键词： 棉花;基因芯片;差异表达基因;实时荧光定量PCR

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2010 年 08 卷 03 期

页码： 488-496

收录情况： CSCD

摘要： 本研究通过3年4环境的田间试验,在BIL(backcross inbred lines)群体中选取断裂比强度最大的材料NMGA-062(32.5cN/tex)和断裂比强度最小的材料NMGA-144(26.67cN/tex),利用Affymetrix棉花基因芯片,比较分析NMGA-062和NMGA-144纤维发育10d时的基因表达谱。在24029条转录本中,两个基因型中差异表达的转录本6504条,占筛选转录本总数的27.07%;其中差异表达倍数在2倍或2倍以上的转录本有3461条,占筛选转录本总数的14.41%,对其进行功能分类。对8个差异表达明显的基因(Ghi.10655.1.S1_s_at,ACO1,ARF1,SAHH,TUA6,TUA7,β-tub1,β-tub10)进行实时荧光定量PCR的检测,发现表达模式均与芯片结果一致,说明芯片数据具有生物学意义上的可重复性,结果是可信的。本研究为以后克隆及功能验证纤维发育相关基因提供了重要参考。

分类号： S562

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