显微介导中国对虾基因鲤转录组测序及差异表达基因分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 闫学春

作者: 闫学春;栾培贤;何立川

作者机构:

关键词: 显微介导;中国对虾总DNA;转录组测序;差异表达基因

期刊名称: 水产学杂志

ISSN:

年卷期: 2022 年 005 期

页码: 1-7

摘要: 运用显微介导的远缘杂交技术,将中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)总DNA直接导人鲤(Cyprinus carpio)受精卵内,创建鲤外源DNA导入系。利用Illumina高通量测序平台,对未进行显微介导和显微介导中国明对虾基因的2种鲤的肌肉组织进行转录组测序分析,结果获得差异表达基因417个,并对其进行GO(Gene Ontology)功能注释和KEGG代谢通路注释,得到18个与氨基酸相关的差异表达基因,其中14个下调基因,4个上调基因。分析发现,其中有2个基因在氨基酸代谢通路中能引起氨基酸含量的升高,即氨甲酰-磷酸合成酶(CPS2)基因和脯氨酰4-羟化酶(P4H)基因。对这2个基因进行实时荧光定量PCR验证发现,其基因的表达趋势与转录组结果一致,从而证实了转录组的分析结果。

分类号: S917.4

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