普通烟草RLP类受体蛋白家族成员的鉴定与进化、表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李奎

作者： 李奎;李晓旭;刘成;段奇佳;郭永峰

作者机构：

关键词： 普通烟草;RLP基因家族;生物信息学分析

期刊名称： 中国烟草科学

ISSN： 1007-5119

年卷期： 2017 年 38 卷 02 期

页码： 63-68

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 类受体蛋白(receptor-like proteins,RLPs)作为一类细胞表面受体,广泛存在于高等植物中,参与调控植物生长发育和抗逆等过程。本研究以普通烟草(Nicotiana tabacum)TN90数据库为基础,构建隐马尔科夫模型进行检索,鉴定了普通烟草RLP家族成员;采用邻接法构建系统发育树进行系统进化分析;利用GSDS对RLP家族成员的基因结构进行了分析;利用普通烟草TN90转录组数据,分析RLP基因家族成员的表达情况;最后对普通烟草RLP家族成员进行GO注释分析。结果表明,在普通烟草中共鉴定出70个RLP家族成员,各成员的氨基酸序列长度和等电点差异较大;系统进化与基因结构分析表明,普通烟草RLP家族成员划分为6个亚家族,基因结构较为简单;转录组分析结果显示,RLP基因家族成员在不同组织和发育时期的表达有较大差异,个别成员在叶片衰老时期表达量较高;GO注释结果表明,RLPs在植物的生长发育、逆境响应等过程中发挥作用。本研究结果将为普通烟草RLP基因功能分析和利用奠定基础。

分类号： S572

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