2016年我国部分地区类NADC30新亚群猪繁殖与呼吸综合征病毒的遗传变异分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张洪亮

作者： 张洪亮;张晶;李真;张文立;刘春晓;陈家锃;相丽润;冷超粮;彭金美

作者机构：

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征病毒;类NADC30;缺失;重组;5亚群

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2016 年 38 卷 09 期

页码： 675-680

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)在我国新的流行特点,本研究根据GenBank中美国2012年提交的PRRSV NADC30株全基因组序列设计合成8对引物,通过RT-PCR的方法对本实验室2016年从4个省搜集的临床样品中检测到的15株类NADC30 PRRSVs株进行了全基因组测序,并且结合参考株进行了序列分析。NSP2推导氨基酸的序列比对表明,15株PRRSVs均具有aa323~aa433+aa484+aa505~aa523(111+1+19)131个氨基酸缺失的分子特征;经RDP4和Simplot生物学软件分析表明,15株PRRSVs中14株为重组病毒株,参与重组的亲本病毒株为PRRSV NADC30株,提供重组基因片段的病毒株为HP-PRRSV或以VR2332为代表的经典PRRSV株,这些类NADC30重组病毒株的重组位置、重组的基因片段及重组片段长度均具有多样性,而且重组的位置多位于编码非结构蛋白或次要结构蛋白的基因区域;全基因组遗传演化分析表明,这些病毒株远离国内之前流行的HP-PRRSV,同源性仅为83.4%~87.2%,而与其它的类NADC30病毒株位于一个相对独立的分支,以上结果均表明这类病毒株已形成了一个新的亚群,命名为5亚群。本研究中不同地区PRRSV的核苷酸同源性差异较大,仅为88.6%~99.6%,并且只有2个病毒株可以感染PAM和MARC-145细胞。本研究表明,以基因缺失和基因重组多样性为主要特征的5亚群PRRSV已在我国流行,其生物学特性有待进一步研究。

分类号： S852.65

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