安徽省部分地区2016–2018年猪圆环病毒2型遗传进化分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 俞赵荣
作者: 俞赵荣;张达;白彩霞;王小朋;杨侃侃;孙裴;李传峰;彭开松;李永东;王勇
作者机构:
关键词: 猪圆环病毒2型(PCV2);基因克隆;ORF2基因;遗传进化分析
期刊名称: 微生物学通报
ISSN: 0253-2654
年卷期: 2019 年 7 期
页码: 1796-1802
摘要: [背景]猪圆环病毒(Porcinecircovirus,PCV)可以引起断奶仔猪多系统衰竭综合症(Postweaningmultisystemicwastingsyndrome,PMWS).[目的]了解安徽省部分地区猪圆环病毒2型(PCV2)的遗传变异情况.[方法]采用PCR技术,对2016-2018年间安徽省部分地区猪场疑似PMWS感染的组织样品共计31份进行PCV2检测和全基因扩增,并通过DNAStar等生物信息学软件对所得到的PCV2毒株基因序列进行遗传进化分析.[结果]所得的8株PCV2安徽株与GenBank上已发表的国内外参考毒株相比较,核苷酸相似性为92.8%-99.0%,ORF2及其推导的氨基酸序列相似性分别为85.8%-99.6%和82.5%-100%.遗传进化树分析结果显示8株安徽株中有1株PCV2a,2株PCV2b,5株PCV2d,未发现PCV2c、PCV2e和PCV2f基因型.此外,通过对ORF2基因编码的氨基酸序列分析,发现各基因型Cap蛋白氨基酸序列上的位点具有其独特性.[结论]近年来PCV2在安徽地区的猪群中感染较为普遍,其中PCV2d基因型的感染病例增多,逐渐成为安徽地区的优势流行株.本研究为安徽地区的PCV2防控提供了一定的参考依据.
分类号: S852.651
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