安徽省部分地区2016–2018年猪圆环病毒2型遗传进化分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 俞赵荣
作者: 俞赵荣;张达;白彩霞;王小朋;杨侃侃;孙裴;李传峰;彭开松;李永东;王勇
作者机构:
关键词: 猪圆环病毒2型(PCV2);基因克隆;ORF2基因;遗传进化分析
期刊名称: 微生物学通报
ISSN: 0253-2654
年卷期: 2019 年 7 期
页码: 1796-1802
摘要: [背景]猪圆环病毒(Porcinecircovirus,PCV)可以引起断奶仔猪多系统衰竭综合症(Postweaningmultisystemicwastingsyndrome,PMWS).[目的]了解安徽省部分地区猪圆环病毒2型(PCV2)的遗传变异情况.[方法]采用PCR技术,对2016-2018年间安徽省部分地区猪场疑似PMWS感染的组织样品共计31份进行PCV2检测和全基因扩增,并通过DNAStar等生物信息学软件对所得到的PCV2毒株基因序列进行遗传进化分析.[结果]所得的8株PCV2安徽株与GenBank上已发表的国内外参考毒株相比较,核苷酸相似性为92.8%-99.0%,ORF2及其推导的氨基酸序列相似性分别为85.8%-99.6%和82.5%-100%.遗传进化树分析结果显示8株安徽株中有1株PCV2a,2株PCV2b,5株PCV2d,未发现PCV2c、PCV2e和PCV2f基因型.此外,通过对ORF2基因编码的氨基酸序列分析,发现各基因型Cap蛋白氨基酸序列上的位点具有其独特性.[结论]近年来PCV2在安徽地区的猪群中感染较为普遍,其中PCV2d基因型的感染病例增多,逐渐成为安徽地区的优势流行株.本研究为安徽地区的PCV2防控提供了一定的参考依据.
分类号: S852.651
- 相关文献
[1]浙江地区猪圆环病毒2型检测及遗传变异分析. 徐丽华,蓝胜芝,余斌,李军星,张鹏超,李宝臣,苏菲,袁秀芳. 2020
[2]猪圆环病毒2型GD株ORF2基区的序列分析. 宋长绪,赵亚华,蒋智勇,王贵平,高向阳. 2005
[3]猪圆环病毒2型GD株ORF2基因的序列分析. 宋长绪,赵亚华,蒋智勇,王贵平,高向阳. 2005
[4]猪圆环病毒2型天津及周边地区分离株的遗传演化分析. 王利丽,郑丽,路超,任卫科,张莉,李富强,鄢明华. 2018
[5]上海郊区猪戊型肝炎病毒分子流行病学调查. 周佳明,陈冈,司伏生,于瑞嵩,陈冰清,谢春芳,李震,董世娟. 2022
[6]一株高病毒载量PCV2毒株的基因组特征及序列分析. 常鑫,蒋智勇,卞志标,徐民生,杨冬霞,杨傲冰,翟少伦. 2024
[7]台州地区规模猪场主要疫病的流行病学调查. 徐丽华,陈冬祥,姚邦,候贤宏,游新根,管妙东,王一成. 2017
[8]天津及周边地区猪圆环病毒2型流行情况调查及分离鉴定. 王利丽,路超,任卫科,韩伟,李富强,郑丽,鄢明华. 2018
[9]猪圆环病毒2型Cap蛋白在烟草叶绿体中的表达(英文). 林优红,程霞英,杨东风,姜永厚,邢少辰,韦正乙,韩蕊莲,梁宗锁,杨宗岐. 2020
[10]NO自由基对猪圆环病毒2型复制的体外抑制作用研究. 李基棕,张冬霞,李丽,薛涛,刘传敏. 2019
[11]猪圆环病毒2型(PCV2)LAMP现场可视化快速检测试剂盒主要原材料的研究. 张琪,张皖静,张晓霞,赵悦琪,吴文静,袁文天,许燕,赵凯. 2020
[12]PCV2感染后JAK-STAT信号通路的基因差异表达分析. 时建立,彭喆,吴晓燕,王硕,孙盼盼,王妍,李俊. 2019
[13]猪圆环病毒2型Taqman荧光定量PCR检测方法的建立及应用. 郑敏,黄梅清,吴南洋,陈少莺. 2011
[14]猪圆环病毒2型Cap蛋白原核可溶性表达及分析. 陈稳,郭军庆,王寅彪,金前跃,郅玉宝,王彦彬,张改平. 2013
[15]检测PCV_2、PPV、PRV疫苗株与野毒株的多重PCR方法. 潘群兴,陈德,何孔旺,黄克和. 2005
[16]猪圆环病毒(PCV)2a/2b亚型毒株灭活疫苗及其重组Cap蛋白亚单位疫苗的交叉保护性试验. 付玉洁,郭龙军,黄立平,危艳武,唐青海,吴洪丽,刘长明. 2012
[17]猪圆环病毒2a/2b亚型病毒株灭活疫苗及其重组Cap蛋白亚单位疫苗的交互免疫实验. 付玉洁,郭龙军,黄立平,危艳武,唐青海,吴洪丽,刘长明. 2012
[18]猪圆环病毒2型荧光抗体的原核表达及初步应用. 乔绪稳,张元鹏,陈瑾,张浩明,侯立婷,杨利,郑其升,侯继波. 2017
[19]2009~2010年华东地区猪圆环病毒2型的基因型分析. 王小敏,张文文,何孔旺,茅爱华,俞正玉,温立斌,倪艳秀,张雪寒,郭容利,吕立新,李彬,周俊明. 2011
[20]检测PCV2、PPV、PRV疫苗株与野毒株的多重PCR方法. 潘群兴,陈德,何孔旺,黄克和. 2005
作者其他论文 更多>>
-
不同植保机械喷雾施药的农药利用率和对马铃薯晚疫病的防效
作者:邹婷婷;张瑞珂;杜亚辉;罗嵘;王忠华;胡彦;王勇;杨代斌;袁会珠;杨春震;闫晓静
关键词:植保机械;植保无人飞机;农药利用率;马铃薯;晚疫病;防治效果
-
宁南山区优质饲草谷子品种筛选及综合评价
作者:杨军学;来幸樑;张尚沛;罗世武;李凯;王湛;王勇;王斐
关键词:饲草谷子;生产性能;营养品质;粗饲料分级指数;灰色关联度分析
-
羊肚菌研究中几个值得关注的问题
作者:彭卫红;闫世杰;周洁;罗建华;王勇
关键词:育种;羊肚菌;新品种;病害;质量安全;连作障碍
-
猪腺病毒3型TaqMan探针荧光定量PCR检测方法建立
作者:解佳;刘静宜;孙彤;郭伟强;俞赵荣;陈鸿军;陈立功
关键词:猪腺病毒3型;hexon基因;TaqMan探针;实时荧光定量PCR
-
不同类型地膜覆盖对宁夏旱作区土壤环境及饲用型作物生长的影响
作者:李凯;罗世武;王湛;杨军学;王勇;王斐;张建彤
关键词:地膜覆盖;饲用玉米;饲用高粱;产量;土壤环境;旱作区
-
外生菌根食用菌驯化栽培技术研究进展
作者:彭卫红;王迪;周洁;崔玉琴;余洋;何晓兰;王勇
关键词:菌根苗合成;菌丝培养;松茸;块菌;酶活性
-
基于代谢组和蛋白组联合分析栽培基质对银耳氨基酸合成的影响
作者:许瀛引;张仕林;罗定平;张谦;舒雪琴;彭卫红;王勇
关键词:银耳;代谢组学;蛋白质组学;氨基酸合成;NADPH路径
