贝母属药用植物叶绿体基因组单核苷酸多态性位点生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 兰青阔

作者： 兰青阔;陈锐;赵新;王成;陈笑芸;汪小福;沈晓玲;刘娜;朱珠;刘征辉;王永

作者机构：

关键词： 贝母;叶绿体基因组;单核苷酸多态性位点;生物信息学分析

期刊名称： 食品安全质量检测学报

ISSN： 2095-0381

年卷期： 2018 年 17 期

页码： 4527-4533

摘要： 目的分析贝母属药用植物叶绿体基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点的分布特点、鉴别能力和应用价值,为中药材贝母精准鉴定方法的建立提供技术支撑。方法应用多重序列比对、SNP筛选、酶切位点分析等生物信息学分析手段,对贝母属6种药用植物的15条叶绿体基因组序列进行分析。结果贝母属叶绿体基因组DNA同源性达98.38%,通过分析共发现SNP位点4058个,其中川贝母类鉴别候选位点71个,瓦布贝母鉴别候选位点个25个,太白贝母鉴别候选位点个120个,浙贝母鉴别候选位点个79个,湖北贝母鉴别候选位点个61个,平贝母鉴别候选位点794个。结论叶绿体基因组SNP分子标记因其密度高、鉴别力强和便于分析的特点,具有较大的应用价值。

分类号： S567.231

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