荔枝果实酸性转化酶LcSAI生物信息学和表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 董晨
作者: 董晨;魏永赞;王弋;郑雪文;李伟才
作者机构:
关键词: 荔枝;酸性转化酶;生物信息学;表达分析
期刊名称: 广西植物
ISSN: 1000-3142
年卷期: 2021 年 006 期
页码: 989-996
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 酸性转化酶作为蔗糖代谢中的关键酶,在还原糖积累型荔枝中表达及酶活性显著高于蔗糖积累型荔枝。为了全面了解酸性转化酶的生物学特征,该文通过运用生物信息学方法对荔枝果实酸性转化酶LcSAI基因的基本理化性质、蛋白二级结构、亲水性/疏水性、跨膜结构域、信号肽、磷酸化位点、保守结构域、系统进化进行系统的分析;利用qRT-PCR技术对LcSAI在’妃子笑’不同组织和果实不同发育阶段进行表达分析。结果表明:(1)荔枝果实酸性转化酶为定位于液泡的亲水性不稳定蛋白,无信号肽,其蛋白的二级结构主要有无规则卷曲和延伸链构件,并散布于整个蛋白;(2)在N-端含有一个跨膜区,包含两个保守结构域,位于N-端的Pfam DUF3357结构域和Glyco32结构域,属于糖基水解酶基因家族32超家族;(3)系统进化分析结果显示LcSAI与龙眼酸性转化酶基因同源,不同组织间LcSAI表达水平为雄花>根>嫩茎>种子>嫩叶>雌花>果皮>老叶,果实不同发育阶段LcSAI表达具有特异性。该研究为深入研究LcSAI果实酸性转化酶基因调控蔗糖代谢途径机理提供数据依据。
分类号: S667.1
- 相关文献
[1]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021
[2]荔枝VQ基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应. 凡超,杨杰,陈蓉,刘伟,向旭. 2024
[3]荔枝铝激活苹果酸转运蛋白基因家族的鉴定及表达分析. 钱义容,王弋,全振炫,郑雪文,李伟才,董晨. 2023
[4]荔枝多胺氧化酶(PAO)基因家族的全基因组鉴定与表达分析. 唐丽雯,张月,岳晓琦,丁峰,胡福初,周开兵,马武强. 2023
[5]荔枝HSP70家族鉴定及其响应非生物胁迫的表达分析. 凡超,杨杰,陈蓉,刘伟,向旭. 2024
[6]荔枝RAV家族转录因子的全基因组鉴定及表达分析. 岳晓琦,杨成坤,张月,唐丽雯,胡福初,王祥和,丁峰,马武强,周开兵. 2022
[7]杨梅酸性转化酶基因cDNA分离及表达分析. 秦巧平,陈俊伟,程建徽,刘晓坤,谢鸣,张上隆. 2006
[8]菠萝酸性转化酶基因家族初步生物信息学及表达分析. 宋康华,侯晓婉,贾志伟,洪克前,谷会,张鲁斌. 2020
[9]荔枝分枝调控基因LcSMXL7的鉴定及功能分析. 王弋,付灯恩,董晨,郑雪文,李伟才. 2023
[10]荔枝转录因子LcZAT12的克隆与表达分析. 卿昊炜,张树伟,莫啸,易晨歆,郭慧勤,韦金菊,吴子昂,徐炯志,贾海锋,邱海吉,张艳青,丁峰. 2024
[11]基于转录组的荔枝泛素结合酶基因家族的鉴定及表达分析. 董晨,李金枝,郑雪文,王弋,李伟才. 2022
[12]荔枝多酚氧化酶基因启动子克隆与功能分析. 王树军,刘保华,孙进华,肖茜,李焕苓,王家保. 2015
[13]荔枝GA2ox基因家族的鉴定及表达分析. 陈哲,王祥和,周文静,周瑞云,吴文碟,吴凤芝,范鸿雁,胡福初. 2021
[14]转录组荔枝Dof基因家族的鉴定及其表达. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2021
[15]荔枝CDPK基因家族鉴定及其在霜疫病胁迫下的表达分析. 刘海伦,严倩,姜永华,史发超,陈洁珍,蔡长河,欧良喜. 2023
[16]基于转录组的荔枝ARF基因家族的鉴定及表达分析. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2017
[17]无核荔枝凝集素基因的克隆与表达分析. 孙科源,纠敏,张新春,李焕苓,王家保. 2011
[18]牵牛E3泛素连接酶PNRma1基因的克隆及抗旱相关性分析. 代锦绣,董轩名,倪欢欢,董延龙,金晓霞. 2017
[19]miR-18a-5p在鸡不同生长时期的表达及其生物信息学分析与靶基因预测. 黄正洋,黄华云,穆春宇,李春苗,王钱保,黎寿丰,赵振华. 2021
[20]大白菜TPS基因家族鉴定及其在高温胁迫下的表达分析. 庞强强,蔡兴来,孙晓东,张文,周曼. 2020
作者其他论文 更多>>
-
3个美国油梨品种在广东湛江引种表现评价
作者:朱利飞;刘丽琴;郑雪文;胡小文;杨转英
关键词:油梨;Hass;引种;花期;花粉萌发率;单果质量
-
荔枝GRF基因家族的全基因组鉴定及表达分析
作者:董晨;郑雪文;王弋;全振炫;李伟才
关键词:荔枝;生长调控因子;生物信息;表达模式
-
六个荔枝品种的挥发性香气成分比较分析
作者:董晨;李金枝;王弋;郑雪文;全振炫;李伟才
关键词:荔枝品种;香气;顶空固相微萃取;GC-MS
-
香蕉枯萎病综合防控研究进展
作者:张妙宜;周登博;起登凤;魏永赞;陈宇丰;冯筠庭;王尉;谢江辉
关键词:香蕉枯萎病;病原菌检测;抗病品种;拮抗微生物;土壤调理;栽培技术
-
特晚熟/晚熟荔枝种质果实可溶性糖组分及含量分析
作者:董晨;郑雪文;黄俏莹;王弋;全振炫;李伟才
关键词:特晚熟/晚熟荔枝;种质资源;可溶性糖
-
3个特早熟荔枝品系在湛江地区引种表现初报
作者:董晨;郑雪文;李金枝;孙健哲;王弋;李伟才;胡桂兵
关键词:特早熟荔枝;引种;湛江
-
优质荔枝品种"岭丰糯"在湛江的引种试验初报
作者:董晨;郑雪文;王弋;全振炫;李伟才
关键词:荔枝;岭丰糯;引种;物候期;果实品质;广东湛江