2016~2021年我国猪伪狂犬病病毒的分子流行病学调查与分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 郭镇洋
作者: 郭镇洋;赵静;付军;许浒;李超;李宛生;孙琪;裴艳艳;龚帮俊;王倩;周国辉;汤艳东;冷超粮;王永杰;陈长青;安同庆;蔡雪辉;张洪亮;田志军;彭金美
作者机构:
关键词: 猪伪狂犬病病毒;变异株;遗传演化;分子特征
期刊名称: 中国预防兽医学报
ISSN: 1008-0589
年卷期: 2023 年 02 期
页码: 122-128+155
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为探究近几年猪伪狂犬病病毒(PRV)在我国的流行情况及遗传演化特征,本研究对2016年~2021年采自全国17个省、市和自治区的2 299份临床样品经PCR检测,并利用PCR扩增阳性样品中的PRVgB、gE和gC基因并测序,采用MegAlign分析三者与GenBank登录的PRV参考株相应基因序列的同源性;利用MEGA 7.0分别构建上述3个基因的遗传进化树,并采用MegAlign分析gB、gE和gC蛋白氨基酸序列的差异,分析其遗传演化及分子特征的变化。结果显示,共扩增出24份PRV阳性样品,阳性率约1.04%,且不同年份及不同地区均有PRV的检出。PRV gB、gE和gC基因序列的同源性及遗传进化分析结果显示,3个基因及其编码氨基酸序列均与2011年以来的PRV变异株同源性最高,且均属于基因Ⅱ型PRV变异株;氨基酸序列比对结果显示,与基因Ⅰ型PRV相比,所测PRV gB、gE和gC中均存在特征性氨基酸突变位点:g B氨基酸序列aa75~aa77连续缺失3个氨基酸(SPG),aa93~aa94连续插入2个氨基酸(DG);g E氨基酸序列在aa48和aa496各插入1个氨基酸(D);g C氨基酸序列在aa63~aa69连续插入7个氨基酸AAASTPA。此外,本研究通过比对国内外经典株以及2011年以来国内PRV g E蛋白的氨基酸序列,确定了不同亚型PRV (即指基因Ⅱ型PRV变异株和经典株)的分子特征即基因Ⅱ型PRV变异株:g E aa496为“D+”或aa496为“D-”+aa448“I”;基因Ⅱ型PRV经典株:gE为aa496“D-”+aa448“V/A”。上述结果表明,我国现阶段仍以基因Ⅱ型PRV变异株的流行为主,进一步明确了不同基因型和亚型PRV的分子特征,对了解我国PRV的流行现状及当前流行株的分子特征具有重要意义,为PRV诊断试剂的研发及PR的防控提供了参考。
分类号: S852.651
- 相关文献
[1]1株鸡传染性支气管炎病毒变异株的分子特征和抗原性分析. 胡北侠,文心田,杨少华,曹三杰,许传田,张琳,黄艳艳,张秀美. 2013
[2]鸭新城疫病毒分离株抗原表位和遗传演化分析. 胡北侠,黄艳艳,路希山,张秀美,许传田,颜世敢,张伟. 2010
[3]中国禽源新城疫病毒(NDV)流行株F和HN基因的遗传演化和变异频率. 徐怀英,黄迪海,张伟,秦春芝,刘星丽,王友令,欧阳文军,秦卓明. 2017
[4]鸭甲型肝炎病毒的遗传演化分析. 马秀丽,冯永胜,郝小静,周围,衣服德,代永联,宋玲玲,谢元超,宋敏训,艾武. 2020
[5]中国部分地区猪流感病毒的遗传演化分析. 于海,周艳君,李国新,闫丽萍,陈宗艳,童光志. 2009
[6]2014-2017年山东省部分规模化猪场PRRSV ORF5基因的遗传演化分析. 曲向阳,孙英军,张洪亮,周磊,刘媛媛,任夫波,赖清华,夏天,周明明,杨汉春. 2018
[7]非洲猪瘟病毒的流行与遗传演化:变与不变. 陈盛媚,王涛,陆战豪,蓝靖,罗瑞,付强,孙元,仇华吉. 2024
[8]一株H1N1亚型猪流感病毒的遗传演化分析及在雪貂体内复制和飞沫传播能力评估. 张奕杰,孟飞,杨焕良,宋祖晨,陈艳,陈化兰. 2023
[9]人源H3N2亚型猪流感病毒A/Swine/Guangdong/1/2005的分离鉴定及全基因遗传演化分析. 许传田,董国英,杨焕良,乔传玲,陈化兰. 2009
[10]2008—2012年山东省鸡传染性支气管炎病毒遗传演化分析和致病性研究. 胡北侠,杨少华,许传田,张伟,张琳. 2014
[11]基于SLAF标签测序分析广东省栽培稻种质资源的遗传结构及演化关系. 孙炳蕊,潘大建,李晨,江立群,张静,吕树伟,刘清,毛兴学,陈文丰,范芝兰. 2022
[12]茶树遗传演化研究进展及SSR在茶树遗传演化研究中的应用前景. 周炎花,姚明哲,陈亮,孙威江. 2009
[13]2012~2016年山东省新城疫病毒的毒力分布、遗传进化、糖基化位点的分析. 袁小远,杨金兴,王永明,王晓丽,亓丽红,王友令,艾武. 2017
[14]云南野生猕猴桃资源不同居群遗传多样性及遗传演化关系. 王连润,万红,陶磅,陈霞,李坤明,沙毓沧. 2024
[15]甘肃、青海和宁夏地区牛病毒性腹泻病毒Erns基因的变异分析. 高闪电,王锦明,田占成,独军政,王建东,常惠芸,关贵全,李有全,殷宏. 2021
[16]中国部分地区猪流感病毒的遗传演化研究. 于海,周艳君,李国新,闫丽萍,陈宗艳,童光志. 2009
[17]7株H3亚型禽流感病毒HA基因的遗传演化分析. 黄建龙,邓国华,谭丹,王昌建,朱春霞,范仲鑫,何世成,汪洪冰,张菁. 2013
[18]猪繁殖与呼吸综合征病毒变异株的致病性试验. 王旭荣,张彩勤,张春红,赵炳武,祝卫国,杨增岐,王建华,宋长绪. 2009
[19]猪源伪狂犬病病毒AH02LA株糖蛋白的基因序列测定与对比分析. 许梦微,王义伟,乔永峰,王志胜,刘娅梅,侯继波,王继春. 2017
[20]猪源伪狂犬病病毒变异株传代致弱株LA2017株的获得与鉴定. 郑亚婷,郭容利,陈赛赛,乔永峰,王志胜,许梦微,刘娅梅,张传健,吕家轩,王继春. 2021
作者其他论文 更多>>
-
作业成本法在农业科研项目成本管理中的应用研究——以L农科院为例
作者:李超;杜雪;宋春雨;蔡静
关键词:作业成本法;农业科研单位;科研项目成本
-
亚甲蓝光化学法病毒灭活血浆外泌体微小RNA差异表达谱分析
作者:陈倩;冯增强;谭琳;饶彩霞;张炯炯;赵静;唐秋萍
关键词:亚甲蓝光化学法;新鲜冰冻血浆;病原体灭活;外泌体;微小RNA
-
长期不同施肥模式对大麦–双季稻田根际土壤有机氮组分的影响
作者:郭勇;文丽;石丽红;张腊梅;程凯凯;李超;郑华斌;唐海明
关键词:长期施肥;双季稻;根际土壤;有机氮组分;酸解性氮
-
苹婆种质果实性状多样性分析与综合评价
作者:罗培四;黄丽君;卢美瑛;李文砚;蒋娟娟;韦优;颜桢灵;赵静;周婧
关键词:苹婆;种质资源;果实性状;遗传多样性;综合评价
-
通平脂肝方对非酒精性脂肪肝小鼠肝组织炎症及TLR4/MyD88/NF-κB通路的影响
作者:王硕;徐文轩;申明宇;李超;喇孝瑾;李继安;齐亚娟;王秀萍;吴哲
关键词:非酒精性脂肪肝;炎症;通平脂肝方;TLR4;MyD88;Ikkβ;NF-κB
-
花生栽培种和野生种Arachis sp.30119六倍体杂种的创制与鉴定
作者:刘华;曾凡佩;王倩;陈国权;苗利娟;秦利;韩锁义;董文召;杜培;张新友
关键词:花生;野生种;六倍体;寡核苷酸荧光原位杂交;分子标记
-
植保无人机喷施棉花脱叶剂与配套助剂使用配比研究
作者:赵静;李海强;刘太杰;陈兵;孙乐鑫;徐新凤
关键词:植保无人机;棉花;脱叶剂;助剂