口蹄疫病毒株OA/58 L蛋白酶的结构构建和功能分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 周建华
作者: 周建华;丛国正;高闪电;常惠芸
作者机构:
关键词: 口蹄疫病毒;L蛋白酶;活性位点
期刊名称: 华北农学报
ISSN: 1000-7091
年卷期: 2007 年 22 卷 04 期
页码: 172-175
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 以口蹄疫病毒株OA/58 RNA为模板,反转录并扩增目的cDNA,然后与pGEM-T Easy载体连接并转化JM109菌株,提取的重组质粒用凝胶电泳、PCR和EcoR I酶切法鉴定。该毒株与A12,O1K,O1Campos和TW45/97毒株序列通过对比分析发现,L基因中有2个起始密码子,第二个是首选;并且确定氨基酸保守区主要位于第35~39,43~54,65~67,75~80,90~111,113~142,144~146,148~157,159~172和176~187位。L蛋白酶含有球状区域,碳端有一柔性杆状结构。合成的L蛋白酶可形成二聚体结构。第144位的Lys、148位的His和163位的Asp可能是L蛋白酶的活性位点。保守区氨基酸残基在维持蛋白的空间构像和功能方面具有重要作用。由拉马钱德兰图可证明本试验构建L蛋白酶的空间结构是合理的,它对于进一步的研究具有指导性。
分类号: S852.65
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