马铃薯块茎和土壤样品中粉痂病菌快速检测方法的建立
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李磊
作者: 李磊;赵昱榕;黄艺烁;吴凤芝;李庆全;石延霞;谢学文;柴阿丽;李宝聚
作者机构:
关键词: 马铃薯;粉痂菌;快速检测;应用
期刊名称: 植物病理学报
ISSN: 0412-0914
年卷期: 2021 年 006 期
页码: 987-995
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 马铃薯粉痂菌(Spongospora subterranea f. sp.subterranea)是引起马铃薯粉痂病的病原。本研究根据粉痂菌内部转录间隔区和线粒体DNA的保守区域,分别设计了2对适用于普通PCR的引物A5/A9、C3/C8和1对适用于荧光定量PCR的引物QF/QR,用于检测块茎和土壤样品中的粉痂菌。特异性检测结果表明:引物对A5/A9和C3/C8,以马铃薯粉痂菌DNA为模板,能分别扩增出264和367 bp大小的单一条带,而对其他非靶标DNA无扩增;引物对QF/QR对马铃薯粉痂菌有单一的熔解峰,说明三对引物特异性良好。灵敏性检测结果表明:荧光定量PCR灵敏度为13.8 fg·μL-1,是普通PCR灵敏度的1 000倍。进一步建立循环域值(Ct)与质粒DNA含量的曲线关系,获得标准曲线y=-3.893 9 x+35.228,R2=0.9966,呈良好线性关系。通过对不同地区采集的18份带菌种薯和18份带菌土壤进行普通PCR和荧光定量PCR检测,引物A5/A9、C3/C8和QF/QR对带菌种薯检测率均为100%,对带菌土壤的检测率分别为44.44%、66.67%和100%。本研究建立的马铃薯粉痂病菌快速检测方法,能及时、准确地检测带菌种薯和土壤,为马铃薯粉痂病的早期诊断和防治提供依据。
分类号: S435.32
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