大豆核孔蛋白GmNup96基因的克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 纪丹丹

作者: 纪丹丹;肖龙;孙培元;刘春燕;傅永福;陈庆山

作者机构:

关键词: 大豆;Gm Nup96;克隆;生物信息学分析

期刊名称: 大豆科学

ISSN: 1000-9841

年卷期: 2016 年 35 卷 05 期

页码: 736-741

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 从大豆品种天隆1号的叶片中克隆Gm Nup96基因的c DNA序列,对其编码的氨基酸序列、蛋白质理化性质、一级结构、二级结构、亚细胞定位等进行了生物信息学分析。结果表明:Gm Nup96基因编码1 022个氨基酸,为具有一定亲水能力的酸性蛋白,不具有信号肽,相对分子量为116.199 7 k Da;二级结构预测结果显示,Gm Nup96序列存在α-螺旋(46.87%)、无规则卷曲(26.32%)、延伸链(17.03%)和β-转角(9.78%),并无其它二级结构;系统进化树分析表明,大豆Gm Nup96基因与野生大豆、芸豆、绿豆、红小豆之间的亲缘关系更近。

分类号: S565.1

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