基于SNP标记的小麦品种遗传相似度及其检测准确度分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 许乃银

作者： 许乃银;金石桥;晋芳;刘丽华;徐剑文;刘丰泽;任雪贞;孙全;许栩;庞斌双

作者机构：

关键词： 小麦（Triticum aestivum L.）;GGE双标图;SNP标记;遗传相似度;位点相似度;准确度

期刊名称： 作物学报

ISSN：

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 887-896

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 遗传相似度检测的准确度估计是对SNP标记法在农作物品种检测体系中应用的必要补充和完善。本研究基于2021年小麦品种SNP标记法跨实验室协同验证实验数据,分析了该方法的检测准确度及在品种间的遗传相似度。分析结果表明:（1） 10个实验室对55组小麦品种组合的标记位点相似度检测的总体准确度约为98%。（2） GGE双标图的品种遗传关系功能图显示,7组小麦品种的组内遗传相似度在95%以上,其余组合的遗传相似度较低。（3）依据GGE双标图的“正确度-精确度”功能图和“准确度排序”功能图,发现洛旱7号/洛旱11等品种组合的相似度检测准确度较高,晋麦47/临抗11的检测准确度一般,而济麦22/婴泊700的检测准确度较差。（4）10个实验室的检测准确度存在显著差异,其中2个实验室检测的正确度、精确度和准确度表现显著差于其余实验室。（5）各实验室检测正确度的容许误差分布于1.3%～1.9%之间,平均为1.5%;准确度的容许误差分布于1.5%～2.0%之间,平均为1.7%。其中,Lab2和Lab3的检测正确度和准确度的容许误差显著差于其余实验室。本研究构建了SNP标记法对品种相似性检测的准确度统计模型,分析了品种组合和实验室的检测准确度及其容许误差,采用GGE双标图方法对检测正确度、精确度和准确度进行可视化分析,验证了各实验室对品种位点相似性检测的准确度和可靠性,为SNP标记法在农作物品种遗传相似性检测中的准确度评价提供了理论支持和应用范例。

分类号： S512.1

  • 相关文献

[1]水稻种质资源全基因组DNA指纹鉴定方法研究. 马小定,崔迪,韩冰,焦成智,韩龙植. 2023

[2]优质高产多抗小麦品种鄂610258的特征特性及栽培技术. 许甫超,徐晴,秦丹丹,彭严春,董静. 2020

[3]基于GYT双标图对北部冬麦区国审小麦品种的回溯分析. 张笑晴,许乃银,孙晶,刘素娟,梁晨,刘林斌,徐剑文,许栩. 2024

[4]优质强筋小麦品种鄂810416的选育. 许甫超,徐晴,秦丹丹,彭严春,董静. 2021

[5]牙鲆连续两代减数分裂雌核发育家系的遗传特征. 王桂兴,刘海金,张晓彦,刘永新,王玉芬,蒋丽. 2012

[6]我国主推玉米品种亲本的遗传结构解析. 李晶晶,张文洋,王利锋,王浩,李会勇. 2021

[7]罗氏沼虾6个养殖群体遗传多样性的微卫星分析. 孙成飞,叶星,董浚键,田园园,梁健辉. 2015

[8]基于二代测序技术的MNP标记鉴别刺芹侧耳菌株. 魏传正,王朦,张鹏,刘芳,严俊杰,谢宝贵,邓优锦,谢路昱. 2023

[9]5个罗非鱼群体的遗传分析与分子标记. 杜诚,卢迈新,叶星,劳海华,黄樟翰,白俊杰. 2005

[10]利用SNP标记对100份玉米种质资源的遗传多样性分析. 孙艳杰,魏国才,吴雨恒,石运强,邵勇,刘英蕊,南元涛,张维耀. 2025

[11]饲用大豆全株蛋白含量关联SSR标记筛选. 李忠旺,陈光荣,刘新星,杨如萍,朱天地,陈琛,陈子萱,陈玉梁. 2023

[12]浙江省水稻种质资源的遗传相似度分析. 严志琴,章孟臣,陈小央,李燕,徐群,王珊,冯跃,魏兴华,杨窑龙. 2025

[13]自动电导滴定仪的构想及其应用. 李建国,张保军. 2009

[14]农业环境样品检测精密度和准确度的控制. 徐亚平,马锦秋,刘凤枝,战新华. 2006

[15]基于二型模糊逻辑系统的改进卡尔曼滤波算法. 华晶,何火娇,王映龙. 2015

[16]逐点线性分析技术及其在分析测试中的应用. 李建国,张保军,刘海霞. 2008

[17]面团流变学特性检测仪器比对试验分析. 魏益民,张波,关二旗,李韦瑾,严军辉. 2010

[18]玉米粉淀粉含量近红外模型建立与优化. 韩洁楠,王美娟,赵训超,鲁鑫,周志强,李明顺,张德贵,郝转芳,翁建峰,雍洪军,李新海. 2020

[19]盐分对土壤水分传感器测量精度的影响及适用性评价. 胡慧玲,王峰,冯泉清,韩其晟,宁慧峰,李小刚,王景雷. 2023

[20]转基因检测标准的方法验证工作研究. 章寅,贾军伟,白蓝,陈一帆,阮功成,吕贝贝,潘爱虎. 2024

作者其他论文 更多>>

微信小程序