杧果中DXR基因的鉴定及与其他果树的比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 盖江涛

作者： 盖江涛;白蓓蓓;叶秀旭;王鹏;党志国

作者机构：

关键词： 杧果,;1-脱氧-D-核酮糖;5-磷酸还原酶(DXR);MEP;萜类

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 21 期

页码： 6938-6944

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 1-脱氧-D-核酮糖5-磷酸还原酶(1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase, DXR)是2-C-甲基-D-赤藓糖醇-4-磷酸(2-C-Methyl-D-erythritol-4-phosphate, MEP)途径的一个关键酶。本研究以杧果DXR基因作为研究目标,通过BLASTP方法获得了甜樱桃、白梨、西洋梨、苹果、桃子、枇杷、金钱橘、甜橙、葡萄、软枣猕猴桃、榴莲、枣、番木瓜、小果野蕉、凤梨的DXR基因的蛋白序列,共18条序列,对其进行了保守结构域、保守基序、系统发育、理化性质、蛋白二级结构分析等研究。保守结构域及保守基序分析结果表明:杧果DXR蛋白包含一个PLN02696结构域,保守结构域内包含5个motif,其宽度、排列顺序与其他15种果树均相同,说明DXR基因家族具有高度保守性。系统发育分析结果显示:单子叶植物纲与双子叶植物纲的DXR基因分别形成了分支,推测在进化过程中DXR基因的分化至少在双子叶植物纲和单子叶植物纲形成之前。理化性质分析及蛋白二级结构分析结果显示:所有蛋白均为酸性、无信号肽蛋白,稳定性蛋白占38.9%,亲水性蛋白占44.4%,杧果DXR蛋白为稳定的亲水性蛋白;杧果DXR蛋白的二级结构主要结构元件是无规则卷曲、α-螺旋。本研究为进一步研究杧果DXR基因在萜类合成途径中的作用提供理论支持。

分类号： S667.7

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